我们正在通过分析迄今为止从未被研究过的微生物的 DNA 来寻找新的抗生素。
共享:
随着抗生素耐药性的上升,对新抗菌药物的需求比以往任何时候都更加明显。 微生物产生多种次生代谢物,介导与自然界中其他生物的交流、竞争和相互作用,并可用作抗生素或抗真菌剂。 目前应用的绝大多数抗生素来自分离的细菌菌株。 然而,微生物的可培养性存在巨大偏差,导致相同物种被持续重新培养,因此重新发现相同的抗微生物剂。
来自土壤生态系统的细菌代表了新抗生素和其他生物活性化合物的有希望的来源,但迄今为止,其中许多仍然无法培养和未表征。 以前从未培养的土壤细菌中筛选生物合成产物的尝试依赖于随机生成的 DNA 文库的表达,这主要是遇到了遗传未优化且通常是碎片化的遗传区域、有限的功能分析以及无法理解负面影响的问题。 结合宏基因组学和合成生物学的靶向方法使我们能够特别关注来自未培养生物的功能有趣的生物合成簇。 在组装的宏基因组测序数据中,我们从从未研究过的细菌物种中鉴定了新的基因簇,它们与已知的天然产物生物合成簇高度相似,并预测了其中许多与抗生素生产之间的功能联系。 通过合成这些基因的 DNA 序列并将它们重新引入实验室表达菌株,我们希望表征它们的代谢产物并探索它们的功能用途。
分享这个项目: