出版物 - 创新基因组学研究所 (IGI)

Rubisco 函数、进化和工程

Prywes N、Phillips NR、Tuck OT、Valentin-Alvarado LE、Savage DF。 生物化学年度评论

肽介导的 CRISPR 酶递送，用于高效编辑原代人淋巴细胞

Foss DV、Muldoon JJ、Nguyen DN、Carr D、Sahu SU、Hunsinger JM、Wyman SK、Krishnappa N、Mendonsa R、Schanzer EV、Shy BR、Vykunta VS、Allain C、Li Z、Marson A、Eyquem J 和 Wilson钢筋混凝土。 自然生物医学工程

SARS-CoV-2 基因组的快速组装揭示了 Omicron BA.1 变体通过 NSP 的衰减

Taha TY、Chen IP、Hayashi JM、Tabata T、Walcott K、Kimmerly GR、Syed AM、Ciling A、Suryawanshi RK、Martin HS、Bach BH、Tsou CL、Montano M、Khalid MM、Sreekumar BK、Kumar GR、Wyman S , 杜德纳 JA, 奥特 M. 自然通讯

Paralog 编辑调整水稻气孔密度以维持光合作用并提高耐旱性

Karavolias NG、Patel-Tupper D、Seong K、Tjahjadi M、Gueorguieva G、Tanaka J、Cruz AG、Lieberman S、Litvak L、Dahlbeck D、Cho MJ、Niyogi KN 和 Staskawicz BJ。 植物生理学

从纳米医学到环境科学的蛋白质电晕

Mahmoudi M、Landry MP、Moore A 和 Coreas R。 自然评论材料

CRISPR-Cas9 介导的木薯 CYP79D1 和 CYP79D2 敲除减弱了有毒氰的产生

Gomez MA、Berkoff KC、Gill BK、Iavarone AT、Lieberman SE、Ma JM、Schultink A、Karavolias NG、Wyman SK、Chauhan RD、Taylor NJ、Staskawicz BJ、Cho MJ、Rokhsar DS 和 Lyons BJ。 Frontiers in Plant Science

使用 SCRuB 的污染源建模改进了微生物组数据的癌症表型预测

Austin GI、Park H、Meydan Y、Seeram D、Sezin T、Lou YC、Firek BA、Morowitz MJ、Banfield JF、Christiano AM、Pe'er I、Uhlemann AC、Shenhav L 和 Korem T。 自然·生物技术“

适配器 LAT 中的单个氨基酸取代可加速 TCR 校对动力学并改变 T 细胞的选择、维护和功能

Lo WL, Kuhlmann M, Rizzuto G, Ekiz HA, Kolawole EM, Revelo MP, Andargachew R, Li Z, Tsai YL, Marson A, Evavold BD, Zehn D, Weiss A. 自然免疫学

使用应变分辨分析识别宏基因组数据中的污染

Lou YC、Hoff J、Olm MR、West-Roberts J、Diamond S、Firek BA、Morowitz MJ 和 Banfield JF。 微生物

水稻体细胞胚起始婴儿潮1 涉及受精卵表达的生长素生物合成基因的激活

Khanday I、Santos-Medellín C 和 Sundaresan V。 New Phytologist

巨型古细菌 Borg 元素中的串联重复经历快速进化并在蛋白质中产生新的本质上无序的区域

舍尔默里奇 MC, S阿赫德瓦 R, 西罗伯茨 J，瓦尔德堡大号及班菲尔德 JF。 PLoS生物学。

用于真核 RNA 敲除和无毒性成像的 CRISPR-Csm

Colognori D 和 Doudna JA。 自然·生物技术“ （关于“CRISPR-Csm 复合物的精确转录本靶向”的研究简报， 自然·生物技术“)

CRISPR-Csm 复合物的精确转录本靶向

Colognori D、Trinidad M 和 Doudna JA。 自然·生物技术“

分裂驱动到全驱动元件的遗传转换

Terradas G、Bennett J、Li Z、Marshall JM 和 Bier E。 自然通讯

小麦病害易感位点高效无外源 DNA Cas9-核糖核蛋白介导的基因编辑优化（普通小麦 L.）

Poddar S、Tanaka J、Running KLD、Kariyawasam GK、Faris JD、Friesen TL、Cho MJ、Cate JHD 和 Staskawicz B。 Frontiers in Plant Science

杂交水稻高频合成无融合生殖

Vernet A、Meynard D…Khanday I、Mercier R、Sundaresan V 和 Guiderdoni E。 自然通讯

Taitingfong RI, Triplett C, Vásquez VN … Marshall JM, Montague M, Morrison AC, Opesen CC, Phelan R, Piaggio A, Quemada H, Rudenko L, Sawadogo N, Smith R, Tuten H, Ullah A, Vorsino A, Windbichler N , Akbari OS, Long K, Lavery JV, Evans SW, Tountas K, Bloss CS。 自然·生物技术“

通过工程化的 CRISPR-Cas12a 改进基因组编辑

Ma E、Chen K、Shi H、Stahl EC、Adler B、Trinidad M、Liu J、Zhou K、Ye J 和 Doudna JA。 核酸研究

SARS-CoV-2 刺突通过整合素和 TGF-β 信号触发屏障功能障碍和血管渗漏

Biering SB、Gomes de Sousa FT、Tjang LV … Näär AM、Baric RS、Stanley SA、Aguilar HC、Esko JD、Chiu CY、Pak JE、Beatty PR、Harris E. 自然通讯

使用 CRISPR-Cas9 修饰染色质以增强基因组编辑

Chen E、Lin-Shiao E、Trinidad M、Saffari Doost M、Colognori D 和 Doudna JA。 PNAS

细菌 CO2 浓缩机制的进化轨迹

Flamholz AI、Dugan E、Panich J、Desmarais JJ、Oltrogge LM、Fischer WW、Singer SW 和 Savage DF。 PNAS

多种病毒编码的 CRISPR-Cas 系统包括简化的基因组编辑器

Al-Shayeb B、Skopintsev P、Soczek KM、Stahl EC、Li Z、Groover E、Smock D、Eggers AR、Pausch P、Cress BF、Huang CJ、Staskawicz B、Savage DF、Jacobsen SE、Banfield JF 和 Doudna JA . 手机

古代起源和受限演化分裂和细胞壁细菌中的基因簇

Megrian D、Taib N、Jaffe AL、Banfield JF 和 Gribaldo S。 自然微生物学

上呼吸道协会肺炎链球菌 SARS-CoV-2 感染在成人中的定植

Parker AM、Jackson N、Awasthi S、Kim H、Alwan T、Wyllie AL、Baldwin AB、Brennick NB、Moehle EA、Giannikopoulos P、Kogut K、Holland N、Mora-Wyrobek A、Eskenazi B、Riley LW 和 Lewnard JA . 临床传染病

甲烷氧化菌中广泛存在的一组大质粒甲烷操作菌古

Schoelmerich MC、Ouboter HT、Sachdeva R、Penev PI、Amano Y、West-Roberts J、Welte CU 和 Banfield JF。 自然通讯

广谱 CRISPR-Cas13a 可实现高效的噬菌体基因组编辑

Adler BA、Hessler T、Cress BF、Lahiri A、Mutalik VK、Barrangou R、Banfield J 和 Doudna JA。 自然微生物学

GBPL3 定位于核孔复合体，并在功能上将核篮与植物的核骨架连接起来

Tang Y, Ho MI, Kang BH, Gu Y. 公共科学图书馆生物学

Borgs 是巨大的遗传元素，具有扩大代谢能力的潜力

Al-Shayeb B、Schoelmerich MC、West-Roberts J、Valentin-Alvarado LE、Sachdeva R、Mullen S、Crits-Christoph A、Wilkins MJ、Williams KH、Doudna JA 和 Banfield JH。自然

重组酶的系统发现，用于将大 DNA 序列有效整合到人类基因组中

Durrant MG、Fanton A、Tycko J…Bassik MC、Bintu L、Bhatt AS 和 Hsu PD。 自然·生物技术“

人类微生物组噬菌体使用替代遗传编码的实验验证

Peters SL、Borges AL、Giannone RJ、Morowitz MJ、Banfield JF 和 Hettich RL。 自然通讯

使用 CRISPR 基因组编辑治疗遗传疾病

Kan MJ 和 Doudna JA。 美国医学会见解

使用混合 ssDNA 修复模板和小分子混合物在原代细胞中进行高产基因组工程

害羞的 BJ、Vykunta VS、Ha A、Talbot A、Roth TL、Nguyen DN、Pfeifer WG、Chen YY、Blaeschke F、Shifrut E、Vedova S、Mamedov MR、Chung JJ、Li H、Yu R、Wu D、Wolf J , Martin TG, Ye L, Esensten JH, Eyquen J 和 Marson A. 自然·生物技术“

T 细胞中的 RASA2 消融可提高抗原敏感性和长期功能

Carnevale J、Shifrut E、Kale N…Eyquem J、Krenciute G、Ashworth N 和 Marson A。自然

精确引导的不育雄性抑制入侵作物害虫的种群

Kandul NP、Liu J、Buchman A、Shriner IC、Corder RM、Warsinger-Pepe N、Yang T、Yadav AK、Scott MJ、Marshall JM 和 Akbari OS。 GEN生物技术

人类皮肤记忆 T 细胞中的单细胞转录梯度限制了 Th17/Tc17 身份

Cook CP、Taylor M、Liu Y…Marson A、Ramos SBV、Cheng JB 和 Cho RJ。 细胞报告医学

通过 Cas2 快速检测唾液中的 SARS-CoV-13 RNA

Chandrasekaran SS、Agrawal S、Fanton A…Fletcher DA、Doudna JA、Savage DF 和 Hsu PD。 自然生物医学工程

一种针对 SARS-CoV-2 的鼻内 ASO 疗法

Zhu C、Lee JY、Woo JZ…Rouskin S 和 Näär AM。 自然通讯

全基因组双向 CRISPR 筛选将粘蛋白鉴定为调节 SARS-CoV-2 感染的宿主因子

Biering SB、Sarnik SA、Wang E…Stanley SA、Harris E、Konermann S 和 Hsu PD。 “自然遗传学

Omicron 突变增强传染性并减少 SARS-CoV-2 病毒样颗粒的抗体中和

Syed AM、Ciling A、Taha TY…Ott M 和 Doudna JA。 PNAS

T细胞耗竭的全基因组CRISPR筛选识别限制T细胞持久性的染色质重塑因子

Belk JA、Yao W、Ly N、... Marson A、Carnevale J、Vardhana SA 和 Satpathy AT。 癌细胞

使用基因组规模的 Perturb-seq 绘制信息丰富的基因型-表型图谱

Replogle JM、Saunders RA、Pogson AN…Jost M、Norman TM 和 Weissman JS。手机

一种天然不含 DNase 的 CRISPR-Cas12c 酶使基因表达沉默

黄 CJ、阿德勒 BA 和 Doudna JA。 分子细胞

小儿肉瘤：下一代分子研究

Giannikopoulos P 和 Parham DM。 MDPI 癌症

CRISPR–Cas 免疫和基因组编辑酶的结构生物学

王 JY、Pausch P 和 Doudna JA。 自然评论微生物学

红细胞分化过程中镰状突变的高水平校正在体内被放大

Magis W, DeWitt MA, Wyman SK, Vu JT, Heo SJ, Shao SJ, Hennig F, Romero ZG, Campo-Fernandez B, Said S, McNeill MS, Rettig GR, Sun Y, Wang Y, Behlke MA, Kohn DB, Boffelli D、Walters MC、Corn JE 和 Martin DIK。 iScience

糖杆菌利用 1 型视紫红质利用光能，该视紫红质可能依赖来自微生物宿主的视黄醛

Jaffe AL、Konno M、Kawasaki Y、Kataoka C、Béjà O、Kandori H、Inoue K 和 Banfield JF。 ISME杂志：微生物生态学多学科杂志

RNA/DNA 链交换结的晶体结构

Cofsky JC、Knott GJ、Gee CL、Doudna JA。 公共科学图书馆之一

CRISPR–Cas9 弯曲和扭曲 DNA 以读取其序列

Cofsky JC、Soczek KM、Knott GJ、Nogales E 和 Doudna JA。 自然结构与分子生物学

解锁基因组学的能力以应对 COVID-19 和未来的流行病

Knyazev S, Chhugani K, Sarwal V, Ayyala R, Singh H, Karthikeyan S, Deshpande D, Baykal PI, Comarova Z, Lu A, Porozov Y, Vasylyeva TI, Wertheim JO, Tierney BT, Chiu CY, Sun R, Wu A , Abedalthagafi MS, Pak VM, Nagaraj SH, Smith AL, Skums P, Pasaniuc B, Komissarov A, Mason CE, Bortz E, Lemey P, Kondrashov F, Beerenwinkel N, Lam TT-Y, Wu NC, Zelikovsky A, Knight R , Crandall KA 和 Mangul S. 自然方法

使用 RNA 病毒对拟南芥进行高效多重双等位基因可遗传编辑

Nagalakshmi U、Meier N、Liu JY、Voytas DF 和 Dinesh-Kumar SP。 植物生理学

人类原代 T 细胞中 HIV 与宿主相互作用的功能图谱

Hiatt J, Hultquist JF, McGregor MJ, Bouhaddou M, Leenay RT, Simons LM, Young JM, Haas P, Roth TL, Tobin V, Wojcechowskyj JA, Woo JM, Rathore U, Cavero DA, Shifrut E, Nguyen TT, Haas KM 、Malik HS、Doudna JA、May AP、Marson A 和 Krogan NJ。 自然通讯

肥胖改变炎症性疾病的病理学和治疗反应

Bapat SP、Whitty C、Mowery CT、Liang Y、Yoo A、Jiang Z、Peters MC、Zhang L、Vogel I、Zhou C 和 Marson A。自然

使用基于 CRISPR-Cas9 的分裂荧光素酶生物传感器对单个细胞中的独特 DNA 序列进行成像

Heath NG、O'Geen H、Halmai NB、Corn JE 和 Segal DJ。 基因组编辑前沿

COVID-19 大流行对加州农场工人心理健康和食品安全的影响

Mora AM、Lewnard JA、Rauch S、Kogut K、Jewell N、Cuevas M 和 Eskenazi B. 农学杂志

在 SARS-CoV-2 Omicron 和 Delta 变体的疫苗突破性感染中中和免疫

Servelita V, Syed AM, Morris MK, Brazer N, Saldhi P, Garcia-Knight M, Sreekumar B, Khalid MM, Ciling A, Chen PY, Kumar GR, Gliwa AS, Nguyen J, Sotomayor-Gonzalez A, Zhang Y, Frias E，普罗斯特科 J，哈克特 Jr. J、Andino R、Wadford DA、Hanson C、Doudna JA、Ott M 和 Chiu CY。手机

一种生成具有外部定向顶膜的人气道上皮类器官的简单方法

Boecking CA、Walentek P、Zlock LT、Sun DI、Wolters PJ、Ishikawa H、Jin B、Haggie PM、Marshall WF、Verkman AS 和 Walter E. Finkbeiner。 肺细胞和分子生理学

嵌合 CRISPR-CasX 酶和引导 RNA 可提高基因组编辑活性

Tsuchida CA, Zhang S, Doost MS, Zhao Y, Wang J, O'Brien E, Fang H, Li CP, Li D, Hai ZY, Chuck J, Brötzmann J, Vartoumian A, Burstein D, Chen XW, Nogales E,杜德娜 JA 和刘 JJG。 分子细胞

通过 CRISPR 碱基编辑鉴定新的 HPFH 样突变，提高胎儿血红蛋白的表达

Sam Ravi N、Wienert B、Wyman SK…DeWitt MA、Crossley M、Corn JE 和 Mohankumar KM。 e生活

CRISPR激活和干扰筛选解码人类原代T细胞的刺激反应

Schmidt R、Steinhart Z、Layeghi M、Freimer JW、Bueno R、Nguyen VQ、Blaeschke F、Ye CJ 和 Marson A. 科学

CRISPR-Cas9介导的核转运和人类原代细胞中纳米结构基因的基因组整合

Lin-Siao E, Pfeifer WG, Shy BR, Doost MS, Chen E, Vykunta VS, Hamilton JR, Stahl EC, Lopez DM, Espinoza CRS, Deyanov AE, Lew RJ, Poirer MG, Marson A, Castro CE, and Doudna JA . 核酸研究

来自加利福尼亚州旧金山湾区的疫苗突破病例中抗体抗性 SARS-CoV-2 变体的优势

Servelita V, Morris MK, Sotomayor-Gonzalez A, Gilwa AS, Torres E, Brazer N, Zhou A, Hernandez KT, Sankaran M, Wang B, Wong D, Wang C, Zhang Y, Reyes KR, Glasner D, Deng X, Streithorst J、Miller S、Frias E、Rodgers M、Cloherty G、Hackett Jr. J、Hanson C、Wadford D、Philip S、Topper S、Sachdev D 和 Chiu CY。 自然微生物学

监督学习模型预测蛋白质对碳纳米管的吸附

Ouassil N、Pinals RL、Del Bonis-O'Donnell JT、Wang JW 和 Landry MP。 科学进展

土壤和沉积物中含有编码新型铜膜单加氧酶 (CuMMOs) 的热原体古细菌

Diamond S、Lavy A、Crits-Christoph A、Carnevali PBM、Sharrar A、Williams KH 和 Banfield JF。 ISME杂志

强大的 T 细胞激活需要 eIF3 驱动的 T 细胞受体翻译爆发

De Silva D、Ferguson L、Chin GH、Smith BE、Apathy RA、Roth TL、Blaeschke F、Kudla M、Marson A、Ingolia NT 和 Cate JHD。 e生活

酸敏感表面活性剂增强核酸的传递

Røise JJ、Han H、Li J、Kerr DL、Taing C、Behrouzi K、He M、Ruan E、Chan LY、Espinoza EM、Reinhard S、Thakker K、Kwon J、Mofrad MRK 和 Murthy N。 分子药剂学

碳纳米管在植物中的生物相容性取决于它们的表面化学

González-Grandío E、Demirer GS、Jackson CT、Yang D、Ebert S、Molawai K、Keller H 和 Landry MP。

双链 DNA 断裂和基因组编辑触发核糖体蛋白 RPS27A 的丢失

Riepe C、Zelin E、Frankino PA、Meacham ZA、Fernandez S、Ingolia NT 和 Corn JE。 FEBS杂志

沙门氏菌噬菌体易感性、交叉抗性和宿主范围的遗传基础

Adler BA、Kazakov AE、Zhong C、Liu H、Kutter E、Lui LM、Nielsen TN、Carion H、Deutschbauer AM、Mutalik VK 和 Arkin AP。 微生物学会

利用 Y 染色体连锁 Cas9 进行性别选择和基因驱动

Gamez S、Chaverra-Rodriguez D、Buchman A、Kandul NP、Mendez-Sanchez SC、Bennett JB、Sánchez C. HM、Yang T、Antoshechkin I、Duque JE、Papathanos PA、Marshall JM 和 Akbari OS。 自然通讯

复杂细菌群落中的物种和位点特异性基因组编辑

Rubin BE、Diamond S、Cress BF、Crits-Christoph A、Lou YC、Borges AL、Shivram H、He C、Xu M、Zhou Z、Smith SJ、Rovinsky R、Smock DCJ、Tang K、Owens TK、Krishnappa N、 Sachdeva R、Barrangou R、Deutschbauer AM、Banfield JF 和 Doudna JA。 自然微生物学

卷曲螺旋形成肽 (KVSALKE)5 是一种细胞穿透肽，可增强蛋白质的细胞内递送

Li J、Tuma J、Han H、Kim H、Wilson RC、Lee HY 和 Murthy N. 先进的医疗保健材料

CRISPR 遇上半胱天冬酶

Hochstrasser ML 和 Nuñez JK。 自然微生物学

在大学环境中通过无症状监测测试优化 COVID-19 控制

Brook CE、Northrup GR、Ehrenberg AJ、Doudna JA 和 Boots M。 流行病

临床拭子和废水样本中的多重 SARS-CoV-2 检测

Stahl EC, Gopez AR, Tsuchida CA, Fan VB, Moehle EA, Witkowsky LB, Hamilton JR, Lin-Shiao E, McElroy M, McDevitt SL, Ciling A, Tsui CK, Pestal K, Gildea HK, Keller A, Sylvain IA, Williams C、Hirsh A、Ehrenberg AJ、Kantor R、Metzger M、Nelson KL、Urnov FD、Ringeisen BR、Giannikopoulos P、Doudna JA 和 IGI 测试联盟。 公共科学图书馆之一

科学家如何看待 CRISPR 的转化前景以及对遗传病个体的影响

Halpern J、O'Hara SE、Owen AL 和 Paolo D. 伦理与人类研究

使用病毒样颗粒快速评估 SARS-CoV-2 进化变种

Syed AM、Taha TY、Tabata T、Chen IP、Ciling A、Khalid MM、Sreekumar B、Chen P、Hayashi JM、Soczek KM、Ott M 和 Doudna JA。科学

想象一下 CRISPR 治愈

乌尔诺夫FD。手机

SARS-CoV-2 nsp1 的 N 端结构域在抑制细胞基因表达和保护病毒基因表达中起关键作用

Mendez AS、Ly M、González-Sánchez AM、Hartenian E、Ingolia NT、Cate JH 和 Glaunsinger BA。 细胞的报告

CRISPR-Cas9 的全面删除图确定了最小的 RNA 引导的 DNA 结合模块

Shams A、Higgins SA、Fellmann C、Laughlin TG、Oakes BL、Lew R、Lukarska M、Arnold M、Staahl BT、Doudna JA 和 Savage DF。 自然通讯

加利福尼亚州蒙特雷县农场工人感染 SARS-CoV-2 的相关危险因素

Mora AM、Lewnard JA、Kogut K、Rauch SA、Hernandez S、Wong MP、Huen K、Chang C、Jewell NP、Holland N、Harris E、Cuevas M、Eskenazi B 和 CHAMACOS-Project-19 研究团队。 JAMA网络

基因编辑在气候变化中的农业应用

Karavolias KG、Horner W、Abugu MN 和 Evanega SN。 可持续粮食系统的前沿

稳定同位素信息、基因组解析的宏基因组学揭示了根际土壤中潜在的跨界相互作用

Starr EP、Shi S、Blazewicz SJ、Koch BJ、Probst AJ、Hungate BA、Pett-Ridge J、Firestone MK 和 Banfield JF。微球

SARS-CoV-2 感染、血清阳性率和 COVID-19 疫苗接种中的健康不平等：东湾 COVID-19 研究的结果

Adams C、Horton M、Solomon O…Coloma J、Lewnard JA、Harris E 和 Barcellos LF。 PLOS 全球公共卫生

超紧凑 CRISPR-CasΦ 效应器的 DNA 干扰状态

Pausch P、Soczek KM、Herbst DA、Tsuchida CA、Al-Shayeb B、Banfield JF、Nogales E 和 Doudna JA。 自然结构与分子生物学

使用串联 CRISPR 核酸酶加速 RNA 检测

Liu TY、Knott GJ、Smock DCJ、Desmarais JJ、Son S、Bhuiya A、Jakhanwal S、Prywes N、Agrawal S、Díaz de León Derby M、Switz NA、Armstrong M、Harris AR、Charles EJ、Thornton BW、Fozouni P , Shu J, Stephens SI, Kumar GR, Zhao C, Mok A, Iavarone AT, Escajeda AM, McIntosh R, Kim S, Dugan EJ, IGI Testing Consortium, Pollard KS, Tan MX, Ott M, Fletcher DA, Lareau LF, Hsu PD、Savage DF 和 Doudna JA. 自然 - 化学生物学

使用唾液样本进行 SARS-CoV-2 监测的机器人 RNA 提取

Hamilton JR、Stahl EC、Tsuchida CA、LinShiao E、Tsui CK、Pestal K、GildeaI HK、Witkowsky LB、Moehle EA、McDevitt SL、McElroy M、Keller A、Sylvain I、Hirsh A、Ciling A、Ehrenberg AJ、Ringeisen BR 、Huberty G、Urnov FD、Giannikopoulos P、Doudna JA 和 IGI SARS-CoV-2 联盟。 公共科学图书馆之一

在植物纳米传感器中：了解用于功能设计的生物冠形成

Voke E、Pinals RL、Goh NS 和 Landry MP。 ACS 出版物

可可高产抗病品种组织培养反应品种筛选及遗传转化的建立

Jones J、Zhang E、Tucker D、Rietz D、Dahlbeck D、Gomez M、Garcia C、Marelli JP、Livingstone III D、Schnell R、Staskawicz B 和 Cho MJ。 体外细胞与发育生物学——植物

基因含量和共现模式限制了候选门辐射细菌中动物关联的进化路径

Jaffe AL、Thomas AD、He C、Keren R、Valentin-Alvarado LE、Munk P、Bouma-Gregson K、Farag IF、Amano Y、Sachdeva R、West PT 和 Banfield JF。 美国微生物学会

番茄中 DMR6 直向同源物的功能丧失赋予广谱抗病性

托马泽拉 DPDT，成 K、Mackelprang R、Dahlbeck D、Geng Y、Gill US、Qi T、Pham J、Giuseppe P、Lee CY、Ortega A、Cho MJ、Hutton SF 和 Staskawicz B。 PNAS

PU.1 突变无丙种球蛋白血症患者染色质可及性受限

Le Coz C、Nguyen DN、Su C…Marson A、Poon GMK 和 Romberg N。 中华实验医学杂志

筛选 FDA 批准的具有抗 SARS-CoV-2 抗病毒活性的生物活性化合物库

Biering SB、Van Dis E、Wehri E…Ott M、Murthy N、Nomura DK、Schaletzky J 和 Stanley SA。 ACS传染病

用碳纳米管提取病毒核酸提高 SARS-CoV-2 定量逆转录聚合酶链反应检测灵敏度

Jeong S、González-Grandío E、Navarro N、Pinals RL、Ledesma F、Yang D 和 Landry MP。 ACS纳米

横纹肌肉瘤：先进的分子方法如何塑造诊断和治疗范式

Giannikopoulos P 和 Parham DM。 儿科和发育病理学

可再生玉米自交系 A188 的染色体水平基因组组装

Lin G, He C, Zheng J, Koo DH, Le H, Zheng H, Tamang TM, Lin J, Liu Y, Zhao M, Hao Y, McFraland F, Wang B, Qin Y, Tang H, McCarty DR, Wei H 、Cho MJ、Park S、Kaeppler H、Kaeppler SM、Liu Y、Springer N、Schnable PS、Wang G、White FF 和 Liu S。 基因组生物学

CRISPR-Cas9 可导致染色体碎裂

乌尔诺夫FD。 “自然遗传学

CRISPR-Cas9 和转基因的靶向递送使复杂的免疫细胞工程成为可能

Hamilton JR、Tsuchida CA、Nguyen DN、Shy BR、McGarrigle ER、Espinoza CRS、Carr D、Blaeschke F、Marson A 和 Doudna JA。 细胞的报告

在大学校园启动基于唾液的 SARS-CoV-2 监测测试计划

Ehrenberg AJ、Moehle EA、Brook CE、Cate AHD、Witkowsky LB、Sachdeva R、Hirsh A、Barry K、Hamilton JR、Lin-Shiao E、McDevitt S、Valentin-Alvarado L、Letourneau KN、Hunter L、Keller A、Pestal K, Frankino PA, Murley A, Nandakumar D, Stahl EC, Tsuchida CA, Gildea HK, Murdock AG, Hochstrasser ML, O'Brien E, Ciling A, Tsitsiklis A, Worden K, Dugast-Darzacq C, Hays SG, Barber CC 、McGarrigle R、Lam EK、Ensminger DC、Bardet L、Sherry C、Harte A、Nicolette G、Giannikopoulos P、Hockemeyer D、Petersen M、Urnov FD、Ringeisen BR、Boots M 和 Doudna JA 代表 IGI SARS- CoV-2 测试联盟。 公共科学图书馆之一

使用 CRISPR-Cas9 核糖核蛋白高效生成同基因原代人骨髓细胞

Hiatt J, Cavero DA, McGregor MJ, Zheng W, Budzik JM, Roth TL, Haas KM, Wu D, Rathore U, Meyer-Franke A, Bouzidi MS, Shifrut E, Lee Y, Kumar VE, Dang EV, Gordon DE, Wojcechowskyj JA、Hultquist JF、Fontaine KA、Pillai SK、Cox JS、Ernst JD、Krogan NJ 和 Marson A. 手机

用于蛋白质递送的纳米颗粒在植物中

Wang JW、Cunningham FJ、Goh NS、Boozarpour NN、Pham M 和 Landry MP。 ScienceDirect

CRISPR 逆转录酶-整合酶复合物活性位点之间的结构协调

Wang JY、Hoel CM、Al-Shayeb B、Banfield JF、Brohawn SG 和 Doudna JA。 自然通讯

在植物中靶向DNA的插入

东 OX 和 Ronald PC。 PNAS

XYZeq：空间分辨单细胞RNA测序揭示了肿瘤微环境中的表达异质性

Lee Y, Bogdanoff D, Wang Yu, Hartoularos GC, Woo JM, Mowery CT, Nisonoff HM, Lee DS, Sun Y, Lee J, Mehdizadeh S, Cantlon J, Shifrut E, Nguyen DN, Roth TL, Song YS, Marson A 、周 ED 和叶 CJ。 科学进展

刺突 L452R SARS-CoV-2 变体的传播、传染性和中和

Deng X、Garcia-Knight MA、Khalid MM、Servellita V、Wang C、Morris MK、Sotomayor-González A、Glasner DR、Reyes KR、Gliwa AS、Reddy NP、San Martin CS、Federman S、Cheng J、Balcerek J、 Taylor J, Streithorst JA, Miller S, Sreekumar B, Chen PY, Schulze-Gahmen U, Taha TY, Hayashi J, Simoneau CR, Kumar GR, McMahon S, Lidsky PV, Xiao Y, Hemarajata P, Green NM, Espinosa A, Kath C、Haw M、Bell J、Hacker JK、Hanson C、Wadford DA、Anaya C、Ferguson D、Frankino PA、Shivram H、Lareau LF、Wyman SK、Ott M、Andino R 和 Chiu CY。手机

硫氰酸盐和有机碳输入驱动特定自养生物的收敛选择阿菲皮亚和硫杆菌复杂微生物组中的菌株

Huddy RJ、Sachdeva R、Kadzinga F、Kantor RS、Harrison STL 和 Banfield JF。 微生物学前沿

NIH 体细胞基因组编辑计划

Saha K, Sontheimer EJ, Brooks PJ, Dwinell MR, Gersbach CA, Liu DR, Murray SA, Tsai SQ, Wilson RC, Anderson DG, Asokan A, Banfield JF, Bankiewicz KS, Bao G, Bulte JWM, Bursac N, Campbell JM , Carlson DF, Chaikof EL, Chen ZY, Cheng RH, Clark KJ, Curiel DT, Dahlman JE, Deverman BE, Dickinson ME, Doudna JA, Ekker SC, Emborg ME, Feng G, Freedman BS, Gamm DM, Gao G, Ghiran IC、Glazer PM、Gong S、Heaney JD、Hennebold JD、Hinson JT、Khvorova A、Kiani S、Lagor WR、Lam KS、Leong KW、Levine JE、Lewis JA、Lutz CM、Ly DH、Maragh S、McCray Jr PB ,, McDevitt TC, Mirochnitchenko O, Morizane R, Murthy N, Prather RS, Ronald JA, Roy S, Roy S, Sabbisetti V, Saltzman WM, Santangelo PJ, Segal DJ, Shimoyama M, Skala MC, Tarantal AF, Tilton JC, Truskey GA、Vandsburger M、Watts JK、Wells KD、Wolfe SA、Xu Q、Xue W、Yi G、Zhou J 和 SCGE 财团

污水、盐、二氧化硅和 SARS-CoV-2 (4S)：一种直接从废水中捕获 SARS-CoV-2 RNA 的经济的无试剂盒方法

Whitney ON、Kennedy LC、Fan VB、Hinkle A、Kantor R、Greenwald H、Crits-Christoph A、Al-Shayeb B、Chaplin M、Maurer AC、Tjian R 和 Nelson KL。 环境科学与技术

CD28 跨膜结构域与 CD28 介导嵌合抗原受体异二聚化

Muller YD、Nguyen DP、Ferreira LMR、Ho P、Raffin C、Valencia RVB、Congrave-Wilson Z、Roth TL、Eyquem J、Gool FV、Marson A、Perez L、Wells JA、Bluestone JA 和 Tang Q。 免疫学前沿

纳米技术推进植物 CRISPR-Cas 基因工程

Demirer GS、Silva TN、Jackson CT、Thomas JB、W Ehrhardt D、Rhee SY、Mortimer JC、Landry MP。 自然纳米技术

基因组编辑以模拟和逆转与骨髓增殖性肿瘤相关的普遍突变。

Baik R、Wyman SK、Kabir S 和 Corn JE。 公共科学图书馆之一

2 年 2020 月至 XNUMX 月美国加利福尼亚州农场工人严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 XNUMX 感染的患病率和临床概况

Lewnard JA、Mora AM、Nkwocha O…Harris E、Cuevas M、Eskenazi B 和代表 CHAMACOS-Project-19 研究小组。 新兴传染病

基于碳纳米管的近红外纳米传感器快速检测 SARS-CoV-2 刺突蛋白。

Pinals RL、Ledesma F、Yang D、Navarro N、Jeong S、Pak JE、Kuo L、Chuang Y、Cheng Y、Sun H 和 Landry MP。 纳米快报

木薯结构基因组学的现状和即将取得的进展。

Lyons JB、Bredeson JV、Mansfeld BN、Bauchet GJ、Berry J、Boyher A、Mueller LA、Rokhsar DS 和 Bart RS。 植物分子生物学

使用自我报告的态度分数验证意见挖掘的情感分析

Featherstone JD 和 Barnett GA。 IEEE Xplore

在大学生中试行综合 SARS-CoV-2 检测和数据系统以控制疫情：一项前瞻性队列研究。

Packel L、Reingold A、Hunter L、Facente S、Li Y、Harte A、Nicolette G、Urnov FD、Lu M、Peterson M 和 IGI 测试联盟。 公共科学图书馆之一

基因组解析的宏基因组学揭示了地下水生态系统中外共生 CPR 细菌和 DPANN 古菌的位点特异性多样性。

He C、Keren R、Whittaker ML、Farag IF、Doudna JA、Cate JHD 和 Banfield JF。 自然微生物学

污水基因组测序检测区域流行的 SARS-CoV-2 变异。

Crits-Christoph A, Kantor RS, Olm MR, Whitney ON, Al-Shayeb B, Lou YC, Flamholz A, Kennedy LC, Greenwald H, Hinkle A, Hetzel J, Spitzer S, Koble J, Tan A, Hyde F, Schroth G、Kuersten S、Banfield JF 和 Nelson KL。 美国微生物学会

抗 CRISPR 病毒式传播：CRISPR-Cas 抑制剂的感染生物学

Li Y 和 Bondy-Denomy J。 细胞宿主与微生物

遗传筛选可识别 SARS-CoV-2 和普通感冒冠状病毒的宿主因子。

Wang R, Simoneau CR, Kulsuptrakul J, Bouhaddou M, Travisano KA, Hayashi JM, Carlson-Stevermer J, Zengel JR, Richards CM, Fozouni P, Oki J, Rodriguez L, Joehnk B, Walcott K, Holden K, Sil A, Carette JE、Krogan NJ、Ott M 和 Puschnik AS。手机

人类分子遗传学和基因组学——重要的进步和令人兴奋的可能性。

柯林斯 FS、Doudna JA、Lander ES 和 Rotimi CN。 新英格兰医学杂志

识别 Twitter 上对疫苗犹豫不决的社区及其地理位置：一种网络方法

Ruiz JB、Featherstone JD 和 Barnett GA。 学术空间

控制和增强 CRISPR 系统

Shivram H、Cress BF、Knott GJ、Doudna JA。 自然 - 化学生物学

比较宿主-冠状病毒蛋白相互作用网络揭示了泛病毒疾病机制。

Gordon DE、Hiatt J、Bouhaddou M…Rosenberg OS、Verba KA、Basler CF、Vignuzzi M、Peden AA、Beltrao P 和 Krogan NJ。科学

直接识别病原体效应子 XopQ 的活化 ROQ1 抗性体的结构。

Martin R、Qi T、Zhang H、Liu F、King M、Toth C、Nogales E 和 Staskawicz B。科学

探索推特上的儿童反疫苗和亲疫苗社区——来自有影响力用户的观点。

Featherstone JD、Barnett GA、Ruiz JB、Zhuang Y 和 Millam BJ。 ScienceDirect

用于靶向基因组工程的紧凑型 Cascade-Cas3 系统。

Csörgő B、León LM、Chau-Ly IJ、Vasquez-Rifo A、Berry JD、Mahendra C、Crawford ED、Lewis JD 和 Bondy-Denomy J。 自然方法

自然发生的 ATP5G1 变体对北极地松鼠神经祖细胞的细胞保护作用。

Singhal NS、Bai M、Lee EM、Luo S、Cook KR 和 Ma DK。 e生活

大肠杆菌中噬菌体抗性景观的高通量图谱。

Mutalik VK、Adler BA、Rishi HS、Piya D、Zhong C、Koskella B、Kutter EM、Calendar R、Novichkov PS、Price MN、Deutschbauer AM 和 Arkin AP。 公共科学图书馆生物学

调节基因调控以治疗遗传疾病。

Matharu N 和 Ahituv N. 自然评论药物发现

控制人类调节性 T 细胞身份的基因网络的功能性 CRISPR 解剖。

Schumann K、Raju SS、Lauber M、Kolb S、Shifrut E、Cortez JT、Skartsis N、Nguyen VQ、Woo JM、Roth TL、Yu R、Nguyen MLT、Simeonov DR、Nguyen DN、Targ S、Gate RE、Tang Q , Bluestone JA, Spitzer MH, Ye CJ, 和 Marson A. 自然免疫学

2 Å 分辨率下细菌核糖体的结构

Watson ZL、Ward FR、Méheust R、Ad O、Schepartz A、Banfield JF 和 Cate JHD。 e生活

提供基因组编辑酶的非病毒策略

Li J、Justad Røise J、He M、Das R、Murthy N. 高级药物递送评论

通过 ddPCR 对大 DNA 切除和倒位进行快速、精确的定量

Watry HL、Feliciano CM、Gjoni K、Takahashi G、Miyaoka Y、Conklin BR 和 Judge LM。 自然的科学报告

新的细菌进化枝揭示了 I Rubisco 型的起源。

Banda DM、Pereira JH、Liu AK、Orr DJ、Hammel M、He C、Parry MAJ、Carmo-Silva E、Adams PD、Banfield JF 和 Shih PM。 自然植物

对 SARS-CoV-2 血清学检测的评估揭示了一系列测试性能。

Whitman JD Hiatt J Mowery CT Shy BR Yu R Yamamoto TN Rathore U Goldgof GM Whitty C Woo JM Gallman AE Miller TE Levine AG Nguyen DN Bapat SP Balcerek J Bylsma SA , Lyons AM, Li S, Wong AW, Gillis-Buck EM, Steinhart ZB, Lee Y, Apathy R, Lipke MJ, Smith JA, Zheng T, Boothby IC, Isaza E, Chan J, Acenas II DD, Lee J, Macrae TA, Kyaw TS, Wu D, Ng DL, Gu W, York VA, Eskandarian HA, Callaway PC, Warrier L, Moreno ME, Levan J, Torres L, Farrington LA, Loudermilk RP, Koshal K, Zorn KC, Garcia-Beltran WF, Yang D, Astudillo MG, Bernstein BE, Gelfand JA, Ryan ET, Charles RC, Iafrate AJ, Lennerz JK, Miller S, Chiu CY, Stramer SL, Wilson MR, Manglik A, Ye CJ, Krogan NJ, Anderson MS, Cyster JG、Ernst JD、Wu AHB、Lynch KL、Bern C、Hsu PD 和 Marson A. 自然·生物技术“

用于在植物中传递 siRNA 的工程 DNA 纳米结构。

Zhang H、Zhang H、Demirer GS、González-Grandío E、Fan C 和 Landry MP。 自然协议

1 类 CRISPR-Cas 效应器的化学：结合、编辑和调节。

Liu TY 和 Doudna JA。 生物化学学报

用于脂肪胺的无痕连接剂，还原后可快速定量断裂。

He M、Li J、Han H、Borges CA、Neiman G、Røise JJ、Hadaczek P、Mendonsa R、Holm VR、Wilson RC、Bankiewicz K、Zhang Y、Sadlowski CM、Healy K、Riley LW 和 Murthy N。 化学科学

种系基因组编辑的上游伦理图谱。

Halpern J 和 Paolo D. 美国生物伦理学杂志

ATF4 调节 MYB 以增加 γ-珠蛋白以响应 β-珠蛋白的丢失。

Boontanrart MY、Schröder MS、Stehli GM、Banović M、Wyman SK、Lew RJ、Bordi M、Gowen BG、DeWitt MA 和 Corn JE。手机

通过 CRISPR-Cas9 引导的腺嘌呤碱基编辑器捕获 DNA。

Lapinaite A、Knott GJ、Palumbo CM、Lin-Siao E、Richter MF、Zhao KT、Beal PA、Liu DR 和 Doudna JA。科学

基因组监测揭示了 SARS-CoV-2 多次传入北加州。

Deng X, Gu W, Federman S, Plessis LD, Pybus OG, Faria NR, Wang C, Yu G, Bushnell B, Pan CY, Guevara H, Sotomayor-Gonzalez A, Zorn K, Gopez A, Servellita V, Hsu E, Miller S, Bedford T, Greninger AL, Roychoudhury P, Starita LM, Famulare M, Chu HY, Shendure J, Jerome KR, Anderson C, Gangavarapu K, Zeller M, Spencer E, Andersen KG, MacCannell D, Paden CR, Li Y , Zhang J, Tong S, Armstrong G, Morrow S, Willis M, Matyas BT, Mase S, Kasirye O, Park M, Masinde G, Chan C, Yu AT, Chai SJ, Villarino Elsa, Bonin B, Wadford DA, 和邱CY。科学

在 Twitter 上探索儿童疫苗接种主题和舆论：语义网络分析

Featherstone JD、Ruiz JB、Barnett GA 和 Millam BJ。 ScienceDirect

来自巨大噬菌体的 CRISPR-CasΦ 是一种超紧凑基因组编辑器。

Pausch P、Al-Shayeb B、Bisom-Rapp E、Tsuchida CA、Li Z、Cress BF、Knott GJ、Jacobsen SE、Banfield JF 和 Doudna JA。科学

植物核膜蛋白质组的全球分析拟南芥.

唐 Y、黄 A 和顾 Y。 自然植物。 新闻与观点.

邻近标记蛋白质组学揭示了植物内核膜蛋白降解的关键调节因子。

Huang A、Tang Y、Shi X、Jia M、Zhu J、Yan X、Chen H、Gu Y。 自然传播。 新闻与观点.

交付挑战：实现治疗性基因组编辑的承诺。

Haasteren JV、Li J、Scheideler OJ、Murthy N 和 Schaffer DV。 自然·生物技术“

SARS-CoV-2感染的全球磷酸化格局。

Bouhaddou M, Memon D, Meyer B, White KM, Rezelj VV, Marrero MC, Polacco BJ, Melnyk JE, Ulferts S, Kaake RM, Batra J, Richards AL, Stevenson E, Gordon DE, Rojc A, Obernier K, Fabius JM , Soucheray M, Miorin L, Moreno E, Koh C, Tran QD, Hardy A, Robinot R, Vallet T, Nilsson-Payant BE, Hernandez-Armenta C, Dunham A, Weigang S, Knerr J, Modak M, Quintero D, Zhou Y, Dugourd A, Valdeolivas A, Patil T, Li Q, Hüttenhain R, Cakir M, Muralidharan M, Kim M, Jang G, Tutuncuoglu B, Hiatt J, Guo JZ, Xu J, Bouhaddou S, Mathy CJP, Gaulton A , Manners EJ, Félix E, Shi Y, Goff M, Lim JK, McBride T, O'Neal MC, Cai Y, Chang JCJ, Broadhurst DJ, Klippsten S, De wit E, Leach AR, Kortemme T, Shoichet B, Ott M、Saez-Rodriguez J、tenOever BR、Mullins D、Fischer ER、Kochs G、Grosse R、García-Sastre A、Vignuzzi M、Johnson JR、Shokat KM、Swaney DL、Beltrao P 和 Krogan NJ。手机

碳纳米载体将 siRNA 传递到完整的植物细胞，以实现有效的基因敲除。

Demirer GS、Zhang H、Goh NS、Pinals RL、Chang R 和 Landry MP。 科学进展

弹出式 SARS-CoV-2 测试实验室的蓝图。

Amen AM、Barry KW、Boyle JM、Brook CE、Choo S、Cornmesser LT、Dilworth DJ、Doudna JA、Ehrenberg AJ、Fedrigo I、Friedline SE、Graham TGW、Green R、Hamilton JR、Hirsh A、Hochstrasser ML、Hockemeyer D , Krishnappa N, Lari A, Li H, Lin-Shiao E, Lu T, Lyons EF, Mark KG, Martell LA, Martins ARO, McDevitt SL, Mitchell PS, Moehle EA, Naca C, Nandakumar D, O'Brien E, Pappas DJ、Pestal K、Quach DL、Rubin BE、Sachdeva R、Stahl EC、Syed AM、Tan I、Tsuchida CA、Tollner A、Tsui CK、Turkalo TK、Urnov FD、Warf MB、Whitney ON 和 Witkowsky LB. 自然生物技术

建立 COVID-19 弹出式测试实验室。

汉密尔顿 J。 CRISPR 期刊

土壤中细菌次生代谢物的生物合成潜力随门、深度和植被类型而变化

Sharrar AM、Crits-Christoph A、Méheust R、Diamond S、Starr EP 和 Banfield JF。 姆比奥

使用 RNA 病毒和移动单向导 RNA 进行多重遗传基因编辑。

Ellison EE、Nagalakshmi U、Gamo ME、Huang P、Dinesh-Kumar S 和 Voytas DF。 自然植物

CDC7 的定时抑制增加了 CRISPR-Cas9 介导的模板化修复。

Wienert B、Nguyen DN、Guenther A、Feng SJ、Locke MN、Wyman SK、Shin J、Kazane KR、Gregory GL、Carter MAM、Wright F、Conklin BR、Marson A、Richardson CD 和 Corn JE。 自然通讯

用于细胞免疫疗法基因组工程的混合敲入靶向

Roth TL, Li PJ, Blaeschke F, Nies JF, Apathy R, Mowery C, Yu R, Nguyen MLT, Lee Y, Truong A, Hiatt J, Wu D, Nguyen DN, Goodman D, Bluestone JA, Ye CJ, Roybal K 、Shifrut E 和 Marson A. 手机

免疫受体 Roq1 赋予对细菌病原体的抵抗力黄单胞菌, 丁香假单胞菌及拉尔斯顿尼亚在番茄中。

Thomas NC、Hendrich CG、Gill US、Allen C、Hutton SF 和 Schultink A. Frontiers in Plant Science

使用 DISCOVER-seq 进行 CRISPR 脱靶检测。

Wienert B、Wyman SK、Yeh CD、Conklin BR 和 Corn JE。 自然协议

钙信号网络激活液泡 K+ 再动员，使植物适应低 K 环境。

Tang RJ、Zhao FG、Yang Y、Wang C、Li K、Kleist TJ、Lemaux P 和 Luan S。 自然植物。 新闻与观点.

细菌藻酸盐调节剂和噬菌体同源物抑制 CRISPR-Cas 免疫。

Adair L、Borges AL、Castro B、Govindarajan S、Solvik T、Escalante V 和 Bondy-Denomy J。 自然微生物学

全基因组内质网自噬筛选突出了线粒体代谢和内质网驻留 UFMylation 的关键作用。

Liang JR、Lingeman E、Luong T、Ahmed S、Muah M、Nguyen T、Olzmann JA 和 Corn JE。手机

使用 CRISPR-Cas9 通过靶向基因插入生成的富含类胡萝卜素的无标记水稻。

Dong OX、Yu S、Jain R、Zhang N、Duong PQ、Butler C、Li Y、Lipzen A、Martin JA、Barry KW、Schmutz J、Tian L 和 Ronald PC。 自然通讯

TOR 动态调节植物细胞间转运。

Brunkard JO、Xu M、Scarpin MR、Chatterjee、Shemyakina EA、Goodman HM 和 Zambryski P. PNAS

来自地球生态系统的巨大噬菌体分支。

Al-Shayeb B、Sachdeva R、Chen LX、Ward F、Munk P、Devoto A、Castelle CJ、Olm MR、Bouma-Gregson K、Amano Y、He C、Méheust R、Brooks B、Thomas A、Lavy A、Matheus -Carnevali P、Sun C、Goltsman DSA、Borton MA、Sharrar A、Jaffe AL、Nelson TC、Kantor R、Keren R、Lane KR、Farag IF、Lei S、Finstad K、Amundson R、Anantharaman K、Zhou J、Probst AJ、Power ME、Tringe SG、Li WJ、Wrighton K、Harrison S、Morowitz M、Relman DA、Doudna JA、Lehours AC、Warren L、Cate JHD、Santini JM 和 Banfield JF。自然

期刊文献

发表于2023

发表于2022

发表于2021

发表于2020