我们正在开发生物信息学方法来研究以前从未研究过的微生物中具有未知功能的蛋白质。
共享:
直到最近十年,由于与研究尚未培养的微生物相关的困难,我们对微生物的认识存在很大偏差。 测序技术和宏基因组支持的基因组恢复的最新进展正在填补这一空白,并已导致发现许多新的尚未培养的微生物群(例如 马古利斯杆菌, 杜氏杆菌)。 一个突出的例子是与候选门辐射(CPR)相关的基因组,在环境和遗传水平上似乎都极为多样化。 此外,CPR 细菌具有非常不寻常的生物学特性,包括细胞体积小、基因组含量减少以及缺乏表现出自由生活生活方式的生物体所需的许多必需基因。
更引人注目的是,大约一半的基因编码具有未知功能的蛋白质。 目前的所有证据都表明 CPR 成员的共生生活方式,因此我们预计这些具有未知功能的蛋白质中的许多将参与 CPR 成员与其伴侣之间的相互作用。 这组蛋白质可能代表了新抗生素和其他生物技术应用的充足储库。 该项目专注于开发一个 在硅片 管道来预测这些蛋白质的未知功能。 这将通过分析它们在从各种环境中检索到的数千个基因组中的分布模式来实现。 这将为使用分子生物学技术更详细地研究这些蛋白质的功能奠定基础。
分享这个项目: