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Paula Cannon 研讨会:优化基因组编辑中的同源定向修复结果
一种常见的方法 基因组编辑 是使用 同源定向修复 (HDR) of 的DNA 由目标创建的中断 核酸酶,如 CRISPR-Cas9, 以指导精确的遗传替换或位点特定的插入。 优化此类 HDR 结果频率的方法通常首先选择具有高活性的靶向核酸酶,通过频率测量 插入 在没有 DNA 同源模板的情况下形成。 相反,我将展示选择 CRISPR 指导RNA 具有特定的 indel 配置文件可以识别指南的子集 核糖核酸 更有可能提供最佳 HDR 结果。 此外,这种方法可以与插入缺失预测程序相结合,以增加识别最佳向导 RNA 的机会,而无需筛选匹配的 CRISPR-Cas9 复合物和同源供体的多种组合。 这对于在初级造血系统中的应用特别有用 细胞,其中同源模板通常基于 AAV 生产成本高昂的矢量,或用于 HDR 与 NHEJ 结果是一个重要的考虑因素。
优化基因组编辑中的同源定向修复结果
分子微生物学与免疫学系特聘教授
美国南加州大学
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