土壤碳可以存在数千年，但有机物的停留时间差异很大，并且通常由不同的微生物过程决定。 根死亡后，腐烂的根组织被一系列微生物定殖，并包裹在富含蛋白质和多糖的细胞外聚合物中。 所有这些材料，以及微生物细胞死亡后释放的细胞内和细胞外生物分子的混合物，都是稳定碳的分子起点。

使用稳定同位素示踪，我们正在使用 IGI 团队成员开创的基因组解析同位素示踪工具来跟踪碳从根部流入土壤微生物群落和周围矿物基质的过程。 我们正在使用宏基因组学来追踪微生物如何对改变的植物性状做出反应，使用 DNA 和矿物结合碳的同位素测量来绘制从植物到微生物并进入地下的碳流。

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