在干细胞模型中扩展遗传方法
ATG 实验室的基石是自动化组织培养系统 (ATTIS),该系统使大规模基因组编辑项目能够生成携带设计突变的同基因 hPSC。 ATTIS 由专家分子生物学家和自动化工程师团队运营,可简化基因编辑 hPSC 的生成和分析,使细胞培养和编辑管道的吞吐量比目前手动进行的 hPSC 编辑实验高 20-50 倍.
ATTIS 在创新基因组研究所 ATG 实验室中运行
ATG 实验室目前正在向以干细胞为重点的研究团队征求合作项目建议,这些项目将在加州大学伯克利分校创新基因组研究所 (IGI) 以及大湾区的机构和社区推进基于干细胞的疾病建模。
与 ATG 的所有项目都是科学合作。我们将与申请人的团队在实验设计、工作流程调整、材料和数据处理以及预算方面合作。 ATG 将承担成功完成该项目的运营成本。申请人将负责试剂和消耗品费用。 ATG 团队的目标是在联合出版物上进行合作,并通过适当的联合专利申请来保护 ATG 实现的技术和科学进步。只要有可能,我们就设想在开源期刊上发表文章,并在细胞系生成后尽快向研究界提供。
所有提案都将由多学科审查委员会进行审查,并根据 ATTIS 和 ATG 团队的兼容性和可用性以及与 IGI 改善人类健康使命的整体一致性进行评估。需要具有处理人类多能干细胞(诱导多能干细胞或人类胚胎干细胞)的经验。项目以合作方式进行,实验室需要能够充分维护返回的 hPSC、处理遗传物质并分析符合商定合作的遗传数据。
如果系统容量允许,我们将每年进行两次公开招募,以支持需要单独编辑 hPSC 的小规模项目。我们希望促进 hPSC 模型在人类疾病研究中更广泛的适应,并为我们当地的干细胞社区服务。
在项目收集期间(能力允许的2月和XNUMX月),欢迎合作者提交他们想要作为同基因hPSC的突变(每个实验室最多XNUMX个). ATG团队将负责整个基因组编辑过程,包括编辑策略设计、组织培养和基因分型。我们将承担运营成本,而试剂成本将取决于合作实验室。
Li H、Bartke R、Zhao L、Verma Y、Horacek A、Ben-Natan AR、Pangilinan GR、Krishnappa N、Nielsen R 和 Hockemeyer D。 自然生物医学工程
(2023)Li H、Busquets O、Verma Y、Syed KM、Kutnowski N、Pangilinan GR、Gilbert LA、Bateup HS、Rio DC、Hockemeyer D 和 Soldner F。 e生活
(2022)对 ATG 实验室内的分子生物学、生物自动化和生物信息学感兴趣的学生和研究人员,请联系 atg_igi@berkeley.edu.