展会活动
IGI 研讨会系列:mRNA 设计的深度测序和深度学习
总结
合成 mRNA 的革命性进展 疫苗 和治疗学暴露了理解 mRNA 设计规则的需要。 尽管已知某些密码子比其他密码子有强烈偏好,但同义词 突变 改变密码子但不改变 氨基酸 被广泛认为是无关紧要的。 尽管如此,我们最近的工作表明,密码子选择会导致数量差异 蛋白质 输出:一般来说,解码越慢 基因,制造的蛋白质越少。 这种对更快密码子的总体偏好被特殊且难以预测的情况所抵消,其中快速 翻译 可以破坏功能,例如,通过干扰共翻译蛋白折叠。 通过结合大规模并行实验和大型语言模型,我们正在构建 mRNA 序列约束模型,这将能够精确设计针对各种条件下的功能优化的合成 mRNA。
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喇叭
藤本植物拉罗 - 助理教授 生物工程系 在伯克利,她使用定量方法了解监管 基因表达. 她的工作将高通量实验方法与计算分析相结合。
她是一名博士后研究员 帕特·布朗的研究组在 生物化学 斯坦福大学的系,得到了来自 Damon Runyon 癌症研究基金会. 她使用生物信息学和实验方法来了解核糖体如何沿着转录物移动。 帕特的实验室关闭后,她在加州大学圣克鲁兹分校花了一年时间研究 基因组 进化项目与 埃德·格林 ,在 古基因组学实验室,然后回到伯克利并作为 QB3 杰出研究员开始了自己的研究小组。
她完成了我的博士学位 分子与细胞生物学 加州大学伯克利分校的系 史蒂文布伦纳,她的本科学位是麻省理工学院的数学和生物学。
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