在大学环境中通过无症状监测测试优化 COVID-19 控制
Brook CE、Northrup GR、Ehrenberg AJ、Doudna JA 和 Boots M。 流行病
(2021)我们正在分享我们的蓝图,以帮助其他组织建立 COVID-19 诊断测试设施。
作为我们的第一步 应对 COVID-19 大流行,IGI 组建了一个专门的团队,他们昼夜不停地工作三周,以建立一个 CLIA 认证的 SARS-CoV-2检测实验室 自 2020 年 XNUMX 月以来一直在测试患者样本。
我们在这个过程中学到了很多东西,并希望分享这些经验教训。 我们希望许多其他团体也能效仿并建立自己的测试实验室。
请阅读我们的开放获取操作指南,链接如下。 如果您有我们指南中无法回答的问题,请联系 igi-covid19@berkeley.edu。 我们将尽最大努力回复查询。
自然·生物技术“ 纸 (六月18,2020)
包含预印本的内容,以及来自早期测试的全自动方法验证和观察结果。
MedRxiv 预印本 (4月24,2020)
包含对迄今为止的监管导航和半自动方法验证的描述。 请参阅本页末尾的补充文件。
IGI 弹出式 COVID-19 测试实验室时间表
我们建立测试实验室的时间表。
我们快速成功的一个关键因素是我们得到了来自 Third Wave Analytics、Salesforce 和 MuleSoft 的深入支持。
在短短几周内,Third Wave Analytics 在其 LockBox 平台上构建了一个强大的实验室信息管理系统 (LIMS),以管理进出实验室的临床样本的技术数据流。 随后,在 Salesforce 和 MuleSoft 的无偿支持下,Third Wave Analytics 还构建并实施了一个符合 HIPAA 标准的安全医师门户,该门户围绕技术 LIM 接受申请并将临床级结果返回给与该机构合作的供应商。
建立这个系统的唯一可能是由于打折的框架和第三波分析程序员不知疲倦和不懈的努力以及来自 Salesforce 的支持所付出的巨大努力。
为了让其他同事能够快速且经济地利用我们的努力,Third Wave Analytics 已同意发布与 IGI 构建相同的框架,仅为其他 UC 的许可费(50 美元)和类似的象征性成本提供 4500% 的折扣对于非 UC 设施。
应该理解,为适应个别设施的任何变化,对 IGI 系统的定制和更改将需要其他费用。 然而,作为参考,IGI 花费了超过 100 万美元来构建其他人现在可以以象征性费用访问的内容。 与提供服务的第三方公司(Salesforce 和 Mulesoft)的集成不受 当前的谅解备忘录 并且可能需要。
公司联络人
第三波分析: 克里斯 Gawronski (cgawronski@thirdwaveanalytics.com)
Salesforce (医生门户网站需要):Tyson Read (tyson.read@salesforce.com)
MuleSoft (纳入 EMR 系统):Sam Steiny (sam.steiny@mulesoft.com)
问题和介绍的内部 UCB 参考: 莎娜·麦克德维特 (shana.mcdevitt@berkeley.edu)
*请在主题行写上“第三波谅解备忘录”
我们早期的测试实验室蓝图预印本是 免费提供 MedRxiv. 该预印本中引用的补充文件包括在下面。 所有支持材料 自然·生物技术“ 版本在该手稿中直接链接。
文件描述和链接 |
Hamilton Microlab STARlet 自动化流程 |
试剂盒准备和患者样本收集和运输 |
人员培训与合规 |
半手动 LIMS 界面 |
半手动 SOP |
补充图1 |
补充图2 |
补充图3 |
Brook CE、Northrup GR、Ehrenberg AJ、Doudna JA 和 Boots M。 流行病
(2021)Hamilton JR、Stahl EC、Tsuchida CA、LinShiao E、Tsui CK、Pestal K、GildeaI HK、Witkowsky LB、Moehle EA、McDevitt SL、McElroy M、Keller A、Sylvain I、Hirsh A、Ciling A、Ehrenberg AJ、Ringeisen BR 、Huberty G、Urnov FD、Giannikopoulos P、Doudna JA 和 IGI SARS-CoV-2 联盟。 公共科学图书馆之一
(2021)Ehrenberg AJ、Moehle EA、Brook CE、Cate AHD、Witkowsky LB、Sachdeva R、Hirsh A、Barry K、Hamilton JR、Lin-Shiao E、McDevitt S、Valentin-Alvarado L、Letourneau KN、Hunter L、Keller A、Pestal K, Frankino PA, Murley A, Nandakumar D, Stahl EC, Tsuchida CA, Gildea HK, Murdock AG, Hochstrasser ML, O'Brien E, Ciling A, Tsitsiklis A, Worden K, Dugast-Darzacq C, Hays SG, Barber CC 、McGarrigle R、Lam EK、Ensminger DC、Bardet L、Sherry C、Harte A、Nicolette G、Giannikopoulos P、Hockemeyer D、Petersen M、Urnov FD、Ringeisen BR、Boots M 和 Doudna JA 代表 IGI SARS- CoV-2 测试联盟。 公共科学图书馆之一
(2021)