IGI COVID-19 研究项目
IGI COVID-19 研究项目
我们正在通过一系列 COVID-19 研究项目迅速开展工作，以更好地了解、检测、追踪和开发新型冠状病毒的治疗方法。
概述
IGI 加快了抗击 COVID-19 大流行的研究工作，通过我们的研究项目为新的 COVID-2 研究项目提供了超过 19 万美元的资金。 快速反应研究 （RRR）基金和实验室 基因组学 研究（LGR） 卓越研究奖（时代）。由于这场公共卫生危机的紧迫性，这笔资金被授予预计将在短短 6 至 12 个月内产生成果的项目。
这些研究项目涵盖了多种方法，旨在快速更好地了解 SARS-COV-2 和 COVID-19 大流行，以跟踪其传播，开发新的诊断和治疗方法，并解决大流行对科学的影响。
我们的 COVID-19 研究
在大学环境中通过无症状监测测试优化 COVID-19 控制。
Cara E. Brook、Graham R. Northrup、Alexander J. Ehrenberg、Jennifer Doudna 和 Mike Boots。
- 出版物： 在大学环境中通过无症状监测测试优化 COVID-19 控制
在大学校园内启动基于唾液的 SARS-CoV-2 监测测试计划。
Alexander J. Ehrenberg、Erica A. Moehle、Cara E. Brook、Andrew H. Doudna Cate、Lea B. Witkowsky、Rohan Sachdeva、Ariana Hirsch、Kerrie Barry、Jennifer R. Hamilton、Enrique Lin-Shiao、Shana McDevitt、Luis Valentin -阿尔瓦拉多、凯特琳 N.莱图尔诺、劳伦亨特、凯瑟琳佩斯塔尔、菲利普 A.弗兰奇诺、安德鲁默利、迪维亚南达库玛、伊丽莎白 C.斯塔尔、康纳土田、霍莉 K. ，卡罗琳雪莉， IGI SARS-CoV-2 联盟、安娜·哈特、盖伊·尼科莱特、佩特罗斯·詹尼科普洛斯、德克·霍克迈尔、玛雅·彼得森、费奥多·D·乌尔诺夫、布拉德利·R·林盖森、迈克·布茨、詹妮弗·A·杜德娜
- 出版物： 在大学校园启动基于唾液的 SARS-CoV-2 监测测试计划
基于 CRISPR 的下一代 SARS-CoV-2 诊断方法
Jennifer Doudna、Patrick Hsu 和 Dave Savage，加州大学伯克利分校。
- 出版物： 使用串联 CRISPR 核酸酶加速 RNA 检测
— 覆盖范围： 使用两种 CRISPR 酶，仅需 20 分钟即可诊断出 COVID
在原始和复杂的生物流体中检测活性 SARS-CoV-2 感染
加州大学伯克利分校的 Markita Landry。
— 研究焦点： Markita Landry 进行基于纳米传感器的快速测试
— 出版： 基于碳纳米管的近红外纳米传感器快速检测 SARS-CoV-2 尖峰蛋白
— 出版： 用碳纳米管提取病毒核酸可提高 SARS-CoV-2 RT-qPCR 检测灵敏度
机器人 RNA 使用唾液样本提取 SARS-CoV-2 监测
Jennifer R. Hamilton, Elizabeth C. Stahl, Connor A. Tsuchida, Enrique Lin-Shiao, C. Kimberly Tsui, Kathleen Pestal, Holly K. Gildea, Lea B. Witkowsky, Erica A. Moehle, Shana L. McDevitt, Matthew McElroy阿曼达·凯勒、伊曼·西尔文、阿丽亚娜·赫什、艾莉森·席林、亚历山大·J·埃伦伯格、 IGI SARS-CoV-2 联盟, Bradley R. Ringeisen, Garth Huberty, Fyodor D. Urnov, Petros Giannikopoulos, Jennifer A. Doudna。
- 出版物： 使用唾液样本进行 SARS-CoV-2 监测的机器人 RNA 提取
IGI-LuNER：SARS-CoV-2 的单孔多重 RT-qPCR 测试
伊丽莎白·C·斯塔尔、康纳·A·土田、詹妮弗·R·汉密尔顿、恩里克·林肖、莎娜·L·麦克德维特、埃里卡·A·莫勒、莉亚·B·维特科斯基、C·金伯利·徐、凯瑟琳·佩斯塔尔、霍莉·K·吉尔迪亚、马修·麦克尔罗伊、Amanda Keller、Iman Sylvain、Clara Williams、Ariana Hirsh、Alison Ciling、Alexander J. Ehrenberg、IGI SARS-CoV-2 联盟、Fyodor D. Urnov、Bradley R. Ringeisen、Petros Giannikopoulos、Jennifer A. Doudna。
- medRxiv 预印本
下一代测序为马达加斯加的 COVID-19 疫情应对提供信息
Cara E. Brook，加州大学伯克利分校。
- 出版物： 一年的基因组监测揭示了 SARS-CoV-2 大流行是如何在非洲展开的
对 COVID-19 患者样本进行快速、低成本、高通量病毒和宏基因组测序，用于疫情监测
加州大学伯克利分校的 Liana Lareau 和 Stacia Wyman。
实时基因组追踪 SARS-CoV-2 在北加州的进化和传播
加州大学旧金山分校的查尔斯·邱。
- 出版物： 基因组监测揭示了 SARS-CoV-2 多次传入北加州
- 出版物： 刺突 L452R SARS-CoV-2 变体的传播、传染性和中和
- 出版物： 来自加利福尼亚州旧金山湾区的疫苗突破病例中抗体抗性 SARS-CoV-2 变体的优势
基于社区的北加州湾区 SARS-CoV-2 无症状携带和血清阳性率的纵向研究
加州大学伯克利分校的 Eva Harris 和 Lisa Barcellos。
- 出版物： SARS-CoV-2 感染、血清阳性率和 COVID-19 疫苗接种中的健康不平等：东湾 COVID-19 研究的结果
基于社区的加州农场工人 SARS-CoV-2 传播监测
Joseph Lewnard、Brenda Eskenazi 和 Ana María Mora-Wyrobek，加州大学伯克利分校。
- 研究聚焦： Brenda Eskenazi 谈加州农场工人面临的风险
- 出版物： 加利福尼亚州蒙特雷县农场工人感染 SARS-CoV-2 的相关危险因素
- 出版物： 加利福尼亚州蒙特雷县农场工人 SARS-CoV-2 感染的流行率和临床特征：2020 年 XNUMX 月至 XNUMX 月
- 出版物： COVID-19 大流行和疫苗犹豫对加利福尼亚州蒙特雷县农场工人的影响
- 出版物： 上呼吸道协会 肺炎链球菌 SARS-CoV-2 感染在成人中的定植
通过对城市废水中 SARS-CoV-19 和 RNA 病毒组的菌株水平监测，早期检测 COVID-2 的重新出现
加州大学伯克利分校的 Kara Nelson 和 Jill Banfield。 阅读更多>
- 研究聚焦： 卡拉纳尔逊关于跟踪通过废水传播
- 出版物： 污水、盐、二氧化硅和 SARS-CoV-2 (4S)：一种经济的无试剂盒方法，可直接从废水中捕获 SARS-CoV-2 RNA
- 出版物： 污水基因组测序检测区域流行的 SARS-CoV-2 变异
发现和靶向 SARS-CoV-2 生命周期背后的 RNA 结构代码
哈尼·古达兹，加州大学旧金山分校。
- 研究聚焦： Hani Goodarzi 关于 RNA 二级结构
SARS-CoV-2宿主依赖性因素的鉴定
加州大学旧金山分校的 Nevan Krogan 和 Melanie Ott。
- 研究聚焦： 梅兰妮·奥特 (Melanie Ott) 谈为病毒寻找细胞“生命线”
— bioRxiv 预印本： 肺类器官中的 SARS-CoV-2 感染研究将 TSPAN8 鉴定为新型介质
- 发布： Plitidepsin 通过靶向宿主蛋白 eEF2A 对 SARS-CoV-1 具有有效的临床前疗效
SARS-CoV-2 感染人体组织细胞和组织发病机制的转录组学特征
布鲁斯·王，加州大学旧金山分校。
— 研究亮点： Bruce Wang 谈创建 COVID-19 病理学图集
- 出版物： 针对 COVID-19 的跨器官普遍转录特征的单核表征
使用基于 CRISPR 的酵母重组工程探索 SARS-CoV-2 病毒
加州大学旧金山分校的 Raul Andino 和 Hiten Madhani。
- 研究聚焦： Hiten Madhani 谈开发减毒活疫苗
抑制 SARS-CoV-2 的毒力 蛋白质 使用功能基因组学和结构生物学
Britt Glaunsinger，加州大学伯克利分校。
- 出版物： CoV-2 nsp1 的 N 端和中央结构域在抑制细胞基因表达和保护病毒基因表达方面发挥关键作用
虚拟指导：COVID-19 对下一代科学劳动力的影响。
Laleh Coté，LBNL 和加州大学伯克利分校； Anne Baranger，加州大学伯克利分校； 和 LBNL 的 Colette Flood。
- 研究聚焦： Laleh Coté 关于虚拟指导
- 出版物： 在 COVID-19 期间在家进行研究的思考
COVID-19复制的结构研究/转录 全息复合体
加州大学伯克利分校的伊娃·诺加莱斯。
QCRG 结构联盟：针对宿主-病原体界面
Oren Rosenberg 和 Kliment Verba，加州大学旧金山分校。
— bioRxiv 预印本： 多篇论文
抑制COVID-19与其肺上皮细胞受体相互作用的决定因素
加州大学旧金山分校的罗伯特·斯特劳德。
— bioRxiv 预印本： 双互补位和多价人 VH 结构域通过靶向 Spike ACE2 结合界面内的不同表位来中和 SARS-CoV-2
— bioRxiv 预印本： SARS-CoV-2 (COVID-19) 的肽解毒剂
表观基因组编辑：一种新的预防性 SARS-CoV-2 治疗方法
加州大学旧金山分校的 Luke Gilbert 和怀特黑德研究所的 Jonathan Weissman。
- 研究聚焦： 卢克吉尔伯特谈表观遗传预处理
基于 Cas9 的穿梭机增强细胞输入和核定位 质粒 的DNA 作为非病毒 SARS-CoV-2 DNA 疫苗的佐剂进入人体试验
加州大学旧金山分校的亚历克斯马森和加州大学伯克利分校的罗斯威尔逊。
SARS-CoV-2 酶的小分子抑制剂的筛选
Dan Nomura、Jamie Cate 等人，加州大学伯克利分校。
- 出版物： 筛选具有抗 SARS-CoV-2 抗病毒活性的 FDA 批准的生物活性化合物库
针对 COVID-19 的反义寡核苷酸疗法的开发
Anders Näär，加州大学伯克利分校。
- 研究聚焦： COVID-19研究焦点：AndersNäär预防分子魔术贴感染
- 出版物： 一种针对 SARS-CoV-2 的鼻内 ASO 疗法