COVID-19 大流行已感染了数千万人，并在全球造成近 40 万人死亡。 与许多其他州和国家一样，加利福尼亚州为所有居民发布了就地避难政策。 这些史无前例的措施已无限期地严重扰乱了该州约 2 万居民的日常生活。 我们面临着一种特殊情况，实时跟踪导致 COVID-19 的病毒 SARS-CoV-XNUMX 对于防止进一步传播至关重要。

我们的目标是对整个北加州受感染患者的 SARS-CoV-2 基因组进行测序。 我们将提供实时监测，通过通知部署有限资源进行检测、接触者追踪和遏制，以帮助公共卫生流行病学响应。 迫切需要实时基因组监测来支持公共卫生基础设施，使社会恢复工作。 由于所有方法、数据和结果都将立即公开共享，因此我们对加利福尼亚州 COVID-19 爆发的影响也将成为其他州和国家的榜样，这些州和国家的爆发轨迹可能会延迟。