IGI 对服务不足的公用事业工人进行 COVID-19 测试

IGI 对服务不足的公用事业工人进行 COVID-19 测试
伯克利新闻 | 罗伯特·桑德斯 | 13 年 2020 月 XNUMX 日

开业一个月后，加州大学伯克利分校的 COVID-19 测试实验室已从评估有症状的学生扩展到评估可能接触新冠状病毒的更广泛人群，包括当地疗养院的居民、东湾的居民无家可归者、前线消防员和警察，以及现在全州的公用事业工人。

由创新基因组学研究所 (IGI) 的志愿者组成的弹出式实验室在 6 月 19 日开放后迅速将其容量提高到每天数百个测试，使其能够响应加州大学伯克利分校以外社区的多项请求。 从那时起，该实验室对接触过疑似 COVID-XNUMX 患者和可能接触过这种疾病的疗养院居民的消防员进行了测试。 它还对无症状的加州大学伯克利分校警察和卫生中心工作人员、伯克利市消防员和东湾卫生诊所的工作人员进行了筛查。 除了对加州大学伯克利分校的学生、教职员工进行检测外，该实验室还专注于弱势群体和每天面临感染风险的一线响应者。

“我们正在为经济上处于不利地位的社区和我们的公务员服务，以确保我们对整个社会产生积极影响，”加州大学伯克利分校分子和细胞生物学教授 Fyodor Urnov 说，他是 IGI 诊断实验室的负责人，是该研究所的技术和翻译科学主任。 “这就是我们。”

IGI 是加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校之间的一项研究合作，旨在推进 CRISPR基于 基因 涉及 CRISPR 等工具的操作Cas9八年前，IGI 创始人詹妮弗·杜德纳 (Jennifer Doudna) 首次将其转变为一项革命性的生物医学技术。

“以这种方式为我们的社区服务是一种荣幸，”加州大学伯克利分校分子与细胞生物学和化学教授、霍华德休斯医学研究所研究员 Doudna 说。 “将我们的测试提供给最需要它们的人至关重要。 我们希望确保基本工作人员的安全，帮助服务不足的人，并努力重新开放校园和加州经济。”

下周，IGI 实验室将开始在该州检测资源有限的地区检查少数公有公用事业 (POU) 的无症状员工，无论这些员工是否被认为已接触过冠状病毒。 POU 是非营利性社区经营的供水和供电供应商，可满足该州约 90% 居民的用水需求和约 25% 的电力需求。

一些 POU 不得不将关键员工安置在附近的公寓或拖车中，以确保他们不会接触 COVID-19。 这对于控制电网和供水基础设施关键点的运营商来说尤其重要。 然而，许多 POU 位于该州的小城镇或地区，无法进入可以对其员工进行评估的医疗中心。

“检查（针对 COVID-19）在这些设置中非常重要，因为如果您在不知情的情况下将无症状的 COVID-XNUMX 患者与轮班期间的其他人隔离，则整个轮班都有生病的风险，”专员凯伦·道格拉斯 (Karen Douglas) 说。加州能源委员会最初与 IGI 取得了联系。 “POU 正在为全州社区提供基本的电力和供水服务。 IGI 能够提供的测试将帮助他们在开展工作时保护他们的工人和设施。”

领导该实验室大部分技术工作的加州大学伯克利分校分子和细胞生物学助理教授德克·霍克迈耶 (Dirk Hockemeyer) 说：“我无法相信，无法对执行如此重要功能的工作人员进行测试。 我们抓住机会提供帮助。”

加州市政公用事业协会执行董事巴里·莫林承认，POU 运营商与该州几乎所有其他人一样，一直对缺乏个人防护设备和测试表示严重关切并直言不讳。 有“这 病毒 那里可能会摧毁一个我们非常紧张的设施，”他说。

“这些人——发电厂工人、线路工人和控制室工人——实际上是在保持水流和灯亮。 我们希望确保我们所做的一切（以防止病毒在公用事业工人中传播）都是有效的，”莫林说。

保护国家电网

目前的计划是将 FedEx 试剂盒——口咽拭子和装有样本的无菌小瓶——送到特洛克和雷丁等地的 POU，远至南加州的针头。 在获得医生的同意后，当地医务人员会在每个地点对大约 XNUMX 名员工进行擦拭，然后将他们开到一个收集点，从那里他们将被运送到加州大学伯克利分校。

目前，该实验室每天可以分析大约 180 个样本，并且正在扩大到运行大约 1,000 个样本，留出空间来容纳公用事业工人的测试。

“许多 POU 想做的是，首先，对可能接触过病毒或因工作非常专业而被隔离的员工进行测试。 也有兴趣对员工进行一定程度的定期筛查，”道格拉斯说。 “每周大约 150 次测试应该可以满足最关键的测试需求，同时也允许进行一定程度的额外筛查。”

“我们对 IGI 所做的事情如此赞赏的原因是，我们很难负担 400 美元的 COVID-19 测试，”莫林说，并指出小型 POU 的大约 2,000 名公用事业工人目前需要某种类型的定期测试。 “让我们的员工重返工作岗位至关重要。 我们正在为我们的社区运营提供基础设施。 让 IGI 以低成本或免费提供这项服务对我们来说是巨大的价值。”

Urnov 表示，IGI 实验室可能会在一周内推出其逆转录酶定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) 分析的高度自动化版本，使其每天可进行 1,000 次测试。 有了这种能力，弹出式实验室将准备好帮助开放该州的经济，并将学生、教职员工带回加州大学伯克利分校的校园。

乌尔诺夫说：“我们和加州大学伯克利分校的校长真正在认真思考以及我们真正努力的目标是安全地重新开放校园。” “我们将发挥关键作用——我们现在所做的一切都是为此做准备。”

加州大学校长珍妮特·纳波利塔诺 (Janet Napolitano) 本月早些时候表示，该系统的 10 个校区可能会在秋季开放，只有一部分学生在校，其余的则在线上课。 这将允许在演讲厅和研讨室以及宿舍中保持社交距离。 然而，为了实现这一目标，校园需要足够的诊断测试来检测新的 COVID-19 病例和无症状病毒携带者，以及进行抗体测试的能力——IGI 也希望扩大这一点——以识别那些以前感染过的人并可能免疫。

“在谈到开放大学时，每个人都说测试能力是一个问题，”乌尔诺夫说。 “所以，我们的工作是说，'测试能力不是问题。'”

将学术实验室转变为生物技术初创公司

Urnov 说，自从 19 月 Doudna 告诉她的 IGI 同事他们需要加紧应对 COVID-XNUMX 大流行以来，他的生活一直是旋风。 那是世界卫生组织宣布全球大流行两天后。

在呼吁志愿者为弹出式诊断实验室配备人员后，862 人提供了帮助。

“我们从 13 月 XNUMX 日开始，一群博士后以他们轻松的学术方式开始，突然间我们不得不处理 CLIA 和 HIPAA 之类的事情，”他说，指的是严格、严肃的联邦要求对临床测试实验室（临床实验室改进修正案）和患者隐私（健康保险流通与责任法案）。

他估计，迄今为止，IGI 已经花费了 XNUMX 万美元来建立认证实验室，这还不包括 Urnov 和 Hockemeyer 等研究生、博士后研究员和教职员工的工资，他们放弃了专业研究，全职投入到实验室。

这些资金，从无限制地捐赠给研究所，使 IGI 能够购买设备、软件、个人防护设备、试剂等等。 加州大学伯克利分校的一些教师为这项工作捐赠了他们自己的实验室设备。 Urnov 和 IGI 的同事甚至采购了供不应求的新拭子，并重新调整分析以与他们合作。

市场上的 COVID-19 检测试剂盒通常与鼻咽拭子一起使用——一根棒子上的小棉球，可以伸到鼻子深处。 他和他的团队不得不使用口咽拭子，这些拭子具有较大的 Q 尖大小的头部，通常用于从口腔和鼻子中部获取样本。 但 IGI 团队证明，两种类型的拭子的测试准确度是相同的。 他们将其中的 1,000 个装入塑料袋，为直接与患者打交道的医务人员制作现成的试剂盒。

IGI 团队编写了他们的弹出式实验室蓝图并将其发布 在线，希望它能帮助其他大学做同样的事情。

“我们已经向医生和 CalREDIE（加州公共卫生部的电子病例报告部门）报告了 1,000 多项测试，”Urnov 说。 “尽我们所能，我们没有犯过一个错误。”

“到目前为止，我们已经免费提供了所有这些测试，”Doudna 补充道。 “我们之所以能够提供这项服务，是因为慷慨的慈善捐赠。 慈善捐款是维持我们测试设施的命脉。”

迄今为止，对于 IGI 团队所服务的不同人群，COVID-19 检测呈阳性的人数比例约为 1% 至 4%。 其半自动化过程的患者周转时间为 24 小时，但该团队可以在短短 5.5 小时内完成实际的拭子分析。

在 Hockemeyer 的领导下，快闪实验室的运作现已成为常规。 Urnov 说，他和该系的几位博士后研究员和研究生在解决无数技术细节方面发挥了重要作用。 7 名志愿者（蓝队）每天早上 XNUMX 点出现，分成更小的小组，接受和处理传入的拭子，将数据输入到 HIPAA 和 CLIA 认证的数据库中，并处理前一天准备的样本。 红队在下午早些时候接管。

其他人支持团队，而 Urnov 和 Hockemeyer 进行故障排除，Urnov 计划未来测试并与许多寻求帮助的组织建立联系。

最近的一个星期天，Urnov 花了大约四个小时来追踪一种特殊墨水的制造商，这种墨水需要为进入拭子套件的样本管打印条形码标签。 制造商声称墨水缺货。 Urnov 最终找到了公司的首席技术官，24 小时后墨水就到了 IGI 的家门口。

“六七个组织——Salesforce，帮助我们建立了数据管理系统； ThermoFisher，制造分析套件； Hamilton，制造自动液体处理机器人； Zebra Technologies 的条码人员 - 他们就像，'我们将竭尽全力为您提供帮助，'”他说。 “人们以真诚的方式回应公共利益。”

所有这些都让 IGI 团队能够为更多需要测试的组织提供服务。 LifeLong Medical Care 服务于服务不足人群的健康需求，已经发送了数百个测试进行分析，其中许多来自街头流浪者。 IGI 最近同意每周测试多达 200 人 Roots 社区健康中心 在奥克兰，该机构为最近被监禁的、低收入的、无家可归的和其他边缘化群体提供服务。

“在我在伯克利的这些年里，我从未像在这次经历中那样感受到与社区的联系，”Hockemeyer 说。 “作为一名研究人员，很难立即看到你的工作产生的影响，并且毫无疑问地看到你做了大量的好事。”

实用集团的 Moline 是团队的感激客户之一。

“好消息是，我们觉得我们好像拥有了可以利用的资源，而几周前，我们感到绝望。 感谢 IGI，我们学会了提出正确的问题，我们已经能够朝着正确的方向前进。 我们不是我们需要的地方，但事情已经开始到位，这是一个巨大的好处，”他说。

媒体联系
费奥多尔·乌诺夫：urnov@berkeley.edu
德克·霍克迈耶：hockemeyer@berkeley.edu