志愿者科学家将在 IGI 的新实验室分析患者样本 COVID-19 诊断测试实验室，周转时间不到 24 小时。
COVID-19 大流行正在恶化，美国严重缺乏快速、可访问和可靠的测试能力。 跟踪和控制 病毒，我们必须测试更多的人。 为应对这一紧迫需求，创新基因组学研究所 (IGI) 发起了一项雄心勃勃的努力，在加州大学伯克利分校校园内建立 COVID-19 诊断测试实验室。 加州大学伯克利分校唐中心和东湾周围的医疗中心将收集患者样本，我们将对这些样本进行检测 SARS-COV-2，导致 COVID-19 的病毒。
使用机器人技术和简化的流程，IGI 测试实验室很快将每天执行 1000 次测试，如有必要，每天最多可以执行 3000 次测试。 通过与加州大学伯克利分校唐中心的协调，根据 CDC、FDA、CDPH 的修订指南以及州长 Gavin Newsom 的紧急声明，我们能够加快临床测试批准过程。
我们预计将在一周内开始测试患者样本，从而显着提高湾区的测试能力和速度。
IGI 是湾区研究合作伙伴，由 Jennifer Doudna 创立，她是 CRISPR. “我们有兴趣为公共利益服务，”杜德纳说。 “我们研究所和社区的专业知识可以通过我们独有的协调能力来应对这一突发公共卫生事件。”
在发出志愿者呼吁后的几个小时内，800 多名当地研究人员主动提出协助我们的测试工作。 在过去的两周里，IGI 研究人员、工作人员和当地志愿者夜以继日地工作以启动和运行测试。 与当地生物技术和数据管理公司的合作对这些努力至关重要。
“第一个目标是人员安全和人为错误最小化，第二个目标是加快结果，”IGI 技术和科学总监 Fyodor Urnov 说。 翻译 和测试工作的领导者。 “我们坐下来说，'我们如何设计这个以获得成功，即使是最坏的情况，我们需要做的测试量？'”
我们正在使用的测试开始于已建立的、经 FDA 批准的、基于 RT-PCR 的测试，该测试寻找存在 病毒 RNA，并在不牺牲准确性的情况下加快吞吐量。
“我们所有的实验室都做 PCR 每天，”杜德娜说。 “但对于这项测试，我们需要超越自我，以确保我们能够提供准确的检测。 我们建立了一个机器人管道，每天进行数千次测试，还有一个管道用于管理数据并将其返回给临床医生。 想象一下，在几周内完成这个过程——通常需要几个月到几年的时间。 这真的很了不起，在我的职业生涯中从未见过。”
IGI 的测试结果将在样本采集后的 12 至 24 小时内提供给卫生保健工作者，这比通常 5 至 7 天的周转时间有了显着改善。 快速检测结果是隔离、跟踪和控制病毒的必要条件。
我们的快速测试协议是与 Chan Zuckerberg Biohub 的类似努力合作开发的，如果没有加州大学伯克利分校健康服务部助理副校长 Guy Nicolette 的支持，就不可能实现； Robert Tjian，加州大学伯克利分校分子与 手机 生物学; Randy Katz，加州大学伯克利分校研究副校长； 和加州大学伯克利分校生物科学学院院长 Mike Botchan。
IGI 还建立了大约十几个 COVID-19 快速反应研究团队，以进行长期工作。 “冠状病毒已经存在很长时间了，我们预计它们不会很快消失，”杜德纳说。 这项研究对于应对当前的大流行和未来的爆发至关重要。
在短短几天内，一百多名当地研究人员聚集在一起组成了快速反应小组，形成了新的合作来应对这场公共卫生危机。 这些团队专注于 COVID-19 诊断、治疗和治疗交付。
一个团队正在努力使用 CRISPR 蛋白质 使便宜 诊断 可以在家里使用。 另一个团队正致力于将治疗分子直接输送到肺部。 其他研究侧重于测试社区和无症状携带者的表面，以更好地了解病毒的传播方式。 这些只是正在进行的创新努力中的一小部分，联合了加州大学伯克利分校、加州大学旧金山分校、格莱斯顿研究所、加州大学戴维斯分校和斯坦福大学等机构。
“这些团体以惊人的速度聚集在一起，”乌尔诺夫说。 “见证这种团队精神一直是我职业生涯的荣幸之一。 你在哪里工作并不重要。 友爱的水平，共同目标的精神，无非是鼓舞人心的。”
创新的 基因组学 Institute (IGI) 是加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校之间的一个非营利性学术合作机构，支持整个湾区的合作研究项目。 IGI 设想的世界 基因组-工程创新造福人类，人人可及。 作为开拓者 基因组编辑、功能基因组学和其他尖端技术，IGI 科学家不断突破科学的界限。
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安迪·默多克：andymurdock@berkeley.edu
