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视角:Cas9 编辑现场会发生什么?
CRISPR-Cas9 有时会对 基因组 比我们想象的要好 - 很高兴知道
周一, 自然·生物技术“ 出版了 纸 题为“修复 CRISPR-Cas9 诱导的 双链 断裂导致大的缺失和复杂的重排,”艾伦布拉德利实验室的科学家说。 这篇回应文章由 IGI 的工作人员和科学领导者撰写,旨在提供对论文结论的看法,并评论作者对数据的解释,以及媒体得出的潜在误导性结论。
我需要知道什么?
在某些情况下,CRISPR 基因组编辑 有时可以删除更大的块 的DNA 超出预期。 研究人员可以注意这一点,如果发生,可以提前计划。
如果您是使用 CRISPR-Cas9 进行基因组编辑鼠标的科学家 细胞 在培养皿中,“信任但要验证”:确认细胞准确地进行了您想要的编辑,因为在某些时候,它们可能缺少更多的遗传物质。
以下部分提供了更详细的信息和分析。
报纸怎么说?
CRISPR-Cas9 已被数千次用于在培养皿以及各种植物和动物中制造细胞,这些细胞具有科学家预期类型的微小遗传变化。 在这项研究中,科学家们将小鼠细胞放入培养皿中,并在两个本地 基因 一个人工的,发现大约 1 次中有 20 次,编辑过程取出了更大的目标基因块。
为什么会出现混淆?
对于在实验室使用基因组编辑的科学家来说,这是否意味着 CRISPR-Cas9 不像 DNA 的剪刀,更像是一个破坏球?
不会。在用于本研究的细胞种类中,有 5% 的时间基因变化比通常检测到的要大。 这是一个有用的发现:科学家们现在将检查培养皿中的基因编辑细胞是否具有他们想要的微小基因变化,而不是不太常见的较大基因变化。 找出这一发现的普遍性也非常重要(即,在更多基因和许多其他不同种类的细胞中寻找如此大的变化)。 报道的那种大的变化并不常见,即使科学家们去寻找它们也是如此。 例如,当科学家对用 CRISPR-Cas9 编辑的小鼠的整个基因组进行测序时,他们只在极少数情况下看到了这种大的变化。
对于旨在使用 CRISPR-Cas9 治疗疾病的科学家和医生来说,这是一个问题吗?
目前没有。 在这一点上根本没有数据可以说明。 想象一下,一架由飞行爱好者(即使是非常有天赋的人)在他们的车库中建造的飞机在其处女航中坠毁。 这会对商业航空产生什么影响?
出于同样的原因,培养皿中的小鼠细胞和用于临床的人类细胞的基因组编辑发生在非常不同的环境中,差异是结果的关键。 该论文不研究人类细胞,也不研究为临床使用而设计的 CRISPR-Cas9,也没有以临床级的方式将 Cas9 与人类细胞结合。 这些并不是细微的差别——它们类似于“GarageJet 001”与“Boeing 777”。
虽然在美国和欧洲,Cas9 还没有被用于在临床上编辑一个人的细胞(此类临床试验将于今年开始),但其他形式的基因组编辑已经开始使用,目前还没有出现安全问题。 我们从这项工作中了解到,美国和欧洲的医生、科学家和监管机构已经制定了仔细检查基因组编辑安全性的方法,这些方法控制着临床上的工作方式。
我们能真正得出什么结论?
CRISPR-Cas9 有时会产生比我们之前想象的更大的遗传变化。 在培养皿中的小鼠细胞中,这种情况大约发生 1 分之一。 这意味着进行实验室研究的科学家需要在将它们用于实验之前检查他们编辑的细胞,并确保他们挑选的细胞具有他们感兴趣的编辑基因类型。考虑基因组编辑治疗用途的研究人员通常已经检查了更大的更改并将其构建到他们的测试中。 目前还不能得出关于使用 CRISPR-Cas20 潜在用于治疗疾病的结论。
底线:
“信任但要验证”:检查培养皿中的细胞,确保它们进行了正确的编辑。
结束思路:
数以千计的实验室正在使用 CRISPR-Cas9,希望我们很快就会知道这项研究的有趣和值得注意的发现是否适用于两个以上的基因和两种不同类型的小鼠细胞。 此类后续研究对于了解此类发现的普遍性至关重要。
媒体联络:
如果您有兴趣与我们的一位科学家讨论这篇论文和我们的观点,请发送电子邮件至 igi-press@berkeley.edu。