
一项新的、敏感的基于唾液的测试将在一小时内给出结果
对 COVID-19 进行简单、快速的检测对于控制病毒的传播至关重要 病毒,尤其是具有更多可传播变体的情况。 IGI 研究人员开发了一种新的、灵敏的唾液测试方法来检测 SARS-COV-2,在一小时或更短的时间内产生结果。
今天的金标准 COVID-19 诊断测试依赖于 PCR,这是一种复制一块 的DNA or RNA. 该测试灵敏度高,仅能检测到一份 病毒 每微升 RNA,但需要专门的设备、冷藏的化学成分、实验室设施,并且需要几个小时才能运行。 通常,患者会在测试后 24-48 小时获得结果。 快速抗原检测或 RAT 因其仅需 15-30 分钟的周转时间而变得越来越流行,但其灵敏度远低于基于 PCR 的检测,并且可能导致假阴性。
测试 COVID-19 的新方法
由 IGI 创始人 Jennifer Doudna 和 IGI 调查员 Patrick Hsu 和 David Savage 领导的团队发表了一篇 纸 in 自然生物医学工程 展示了一个新的原型,它使用了 CRISPR 酶 在一小时或更短的时间内检测少量 SARS-CoV-2 RNA。
“詹妮弗、帕特里克和戴夫一开始就与我们分享的愿景是,工作场所的前门可以有盒子。 当你进去的时候,你往一个墨盒里吐口水,把墨盒放在一个盒子里,30 分钟后你就可以在手机上看到结果,”共同第一作者、Hsu 实验室的研究生研究员 Sita Chandrasekaran 说。

虽然这项名为 DISCovER 的测试不像传统的基于 PCR 的 COVID-19 诊断测试那样敏感,但它比 RAT 敏感得多,并且可以在类似的环境中使用——样本是通过在试管中吐痰来采集的,而不是与更具侵入性的鼻拭子相比。
“首先,我们希望构建能够快速为您提供结果的东西,”共同第一作者、Hsu 实验室的研究助理 Aditya Jangid 说。 “其次,我们希望开发一种测试,您不必进入诊所提供样本然后等待您的结果 - 目标是制作一个可以做所有事情的独立系统。”

今天在 Nature Biomedical Engineering 中描述的 DISCover 测试使用廉价、耐储存的化学溶液。 用户将唾液样本提供给微流控盒,然后将其插入紧凑型设备中,自动处理样本并给出读数。 在该设备中,使用称为 LAMP 的过程而不是传统的 PCR 来复制存在的任何病毒 RNA。 LAMP 可以在相对较短的时间内在恒定温度下进行,无需在 PCR 中使用昂贵的热循环装置。 当病毒 RNA 存在时,一种 CRISPR 相关酶, Cas13,激活用作测试读数的荧光信号。
该测试旨在检测迄今为止发现的所有 SARS-CoV-2 变体,但该研究的意义超出了 COVID-19。
超越COVID-19

“DISCOVER 原型的一个令人兴奋的方面是它确实是一个模块化系统,”加州大学伯克利分校助理教授、帕洛阿尔托 Arc 研究所的联合创始人 Patrick Hsu 说。 “我们可以快速轻松地对其进行调整,以测试可以在唾液中检测到的任何感染。 可以开发这种类型的即时护理原型来测试常见的感染,如链球菌性咽喉炎、单核细胞增多症或疱疹病毒感染,以及 HIV、肝炎病毒、麻疹等。 我们的目标是让个人能够快速获得可以与医疗保健提供者现场讨论的结果。”
该测试是不断发展的基于 CRISPR 的诊断领域的一部分,该领域利用 CRISPR 酶定位特定基因序列的能力,而不是切割 DNA 基因组编辑 诊断触发标记的释放,指示存在特定的 病原. 除了 DISCovER 测试之外,IGI 研究人员还开发了一种无需放大的测试,以及一种基于手机的设备,该设备可以快速检测来自与 Gladstone 研究所研究人员合作的基于 CRISPR 的测试中的荧光标记。
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安迪·默多克,andymurdock@berkeley.edu