展会活动
Liana Lareau 研讨会:为沉默的突变发声
同义密码子选择可以对核糖体速度产生巨大影响, RNA 稳定性和 蛋白质 表达. 核糖体分析实验强调核糖体不会沿着 mRNA 均匀移动,这表明需要建立 翻译 捕捉经验观察到的所有变化。 从核糖体分析的经验数据开始,我们使用前馈神经网络对翻译延伸的变化进行建模,以预测核糖体沿 mRNA 的分布作为其序列的函数。 我们应用我们的模型来设计酵母中荧光蛋白的同义变体,并得出结论,单独控制翻译延伸就足以在蛋白质输出中产生大量的定量差异。 这为我们提供了一种经验方法来学习密码子偏好并将该知识应用于合成序列设计。 它还为衡量所谓的沉默的影响开辟了道路 突变 在人类中 基因:我们现在意识到的同义替换可能会影响蛋白质表达而不改变 氨基酸 序列。
为沉默的突变发声:
核糖体解码的机器学习模型
生物工程系助理教授
美国加州大学伯克利分校
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