Estamos secuenciando genomas virales de SARS-CoV-2 en muestras de pacientes positivas para COVID-19 de East Bay, lo que proporcionará información crítica para rastrear su propagación y seleccionar terapias para combatir la pandemia global más amplia.
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La secuenciación de genomas virales de SARS-CoV-2 de todo el mundo es fundamental para rastrear la propagación de COVID-19 y apuntar con precisión a vacunas, medicamentos y diagnósticos de próxima generación. Ha surgido un esfuerzo público masivo, pero en gran parte sin financiamiento, en torno a este objetivo compartido. Estamos secuenciando genomas virales completos de muestras de pacientes positivas para SARS-CoV-2 de la región de East Bay de California, con los objetivos inmediatos y críticos de contribuir con el conocimiento a este esfuerzo público y permitir innumerables estudios de investigación locales.
Inicialmente, los datos de secuenciación del genoma viral son esenciales para comprender la dinámica de transmisión e informar las respuestas de salud pública, incluido el rastreo de contactos y las estrategias generales de contención y mitigación. Nuestro análisis genómico comparativo nos permitirá comprender la variación genómica del SARS-CoV-2 en East Bay y cómo encaja en el contexto más amplio de la pandemia. Los genomas secuenciados nos permitirán identificar la aparición de variantes clínicamente relevantes relacionadas con la virulencia y la posible alteración del diagnóstico y la terapéutica.
Este trabajo está financiado por el Laboratorio de Investigación Genómica (LGR), una colaboración entre UC Berkeley / UCSF (IGI) y GlaxoSmithKline.
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