El monitoreo de aguas residuales tiene el potencial de rastrear cuantitativamente la prevalencia del SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19, entre muchos miles de personas al analizar una muestra de una sola estación de recolección, y brindar una alerta temprana sobre cambios en la prevalencia antes de dicha información está disponible a partir de pruebas individuales o datos de ingreso hospitalario. Dicha información podría proporcionar información valiosa sobre las políticas de COVID-19 a medida que se modifican las restricciones de refugio en el lugar. 

Nuestro equipo está desarrollando métodos para medir con precisión las cantidades de SARS-CoV-2 en las aguas residuales, incluidas cepas virales específicas mediante amplicón y secuenciación directa. Los resultados proporcionarán información sobre qué cepas virales están circulando en nuestras comunidades y si se están introduciendo nuevas cepas de otras regiones debido a un mayor contacto y viajes. Nuestro objetivo es integrar la concentración de aguas residuales y los datos de nivel de deformación con pruebas de diagnóstico y otros datos de salud pública para proporcionar una imagen más completa que puedan utilizar las autoridades sanitarias y los responsables de la toma de decisiones. El desarrollo de métodos exitosos para metavirómicos resueltos por cepas será aplicable para detectar la presencia de nuevos patógenos que amenacen con causar futuras epidemias.