Estamos realizando una investigación estructural sobre la replicación de SARS-CoV-2 con el fin de encontrar nuevos objetivos para los tratamientos de COVID-19.
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El SARS-CoV-2 utiliza un complejo de ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp) para replicar y transcribir el genoma viral. Debido a que este complejo es crucial para la propagación viral, es un candidato principal como objetivo farmacológico contra COVID-19. Además del núcleo RdRp que incluye la ARN polimerasa NSP12 y los factores de fidelidad NSP7 / 8, el holocomplejo incluye varias otras proteínas virales que desempeñan funciones críticas en la fidelidad de la síntesis y el procesamiento del ARN: (i) el virus mantiene sus genomas grandes por codificar un complejo de corrección de pruebas de NSP10 / 14 que elimina los nucleótidos mal incorporados; (ii) el ARNm sintetizado por RdRp requiere que un casquete de mGpppA sea traducido por el ribosoma del huésped, por lo que NSP10 / 14 primero encapsula el ARN con un casquete de GpppA y luego NSP10 / 16 lo metila; (iii) NSP13 juega un papel en la separación de la hebra de producto recién sintetizada de la hebra molde, mientras que NSP9 estabiliza los dos ARN monocatenarios.
Nuestro objetivo es reconstituir y determinar la estructura del holocomplejo SARS-CoV-2 RdRp durante las etapas de inicio de la síntesis de ARN, taponamiento y corrección de pruebas utilizando microscopía crioelectrónica para comprender mejor cómo se replica el SARS-CoV-2 y transcribe su genoma. Este nivel mecanicista de comprensión abrirá nuevas puertas para el desarrollo de fármacos para combatir el COVID-19 que explotan nuevos sitios para la unión de fármacos y la inactivación compleja.
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