Un sistema compacto Cascade – Cas3 para la ingeniería del genoma dirigida.
Csörgő B, León LM, Chau-Ly IJ, Vasquez-Rifo A, Berry JD, Mahendra C, Crawford ED, Lewis JD y Bondy-Denomy J. Nature Methods
(2020)Estamos desarrollando una herramienta basada en CRISPR-Cas3 para generar grandes deleciones de ADN de forma programable.
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La capacidad de manipular genomas de la manera que uno elija permite avances científicos, nueva capacidad biosintética y nuevos medicamentos. Todos los organismos poseen genes y regiones de función desconocida, cuya eliminación y / o sustitución permitiría interrogar su función. Las tecnologías CRISPR-Cas han proporcionado herramientas de edición de genes programables que han revolucionado la investigación. los Las principales enzimas CRISPR-Cas9 y Cas12a son ideales para la manipulación genética programada, sin embargo, están limitadas para intervenciones a escala del genoma. Aquí, proponemos utilizar la enzima Cas3, que naturalmente posee actividad nucleasa acoplada y helicasa y es capaz de deleciones> 250 kb, para propósitos de ingeniería del genoma. Aprovecharemos Cas3 para permitir la eliminación e interrogación experimental de genes completos, operones, islas, provirus y elementos repetitivos. en masa. Los sistemas CRISPR-Cas3 son fácilmente programables, poseen una amplia diversidad en genomas secuenciados y ocurren naturalmente en muchos microbios. Si tiene éxito, la implementación a gran escala de la tecnología CRISPR-Cas3 tiene el potencial de mejorar en gran medida múltiples aplicaciones de biología sintética y presentar una herramienta novedosa para el análisis de la materia oscura genómica.
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