Estamos utilizando la secuenciación de próxima generación para rastrear y reducir la propagación de COVID-19 en Madagascar.
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Estamos implementando un proceso de diagnóstico de SARS-CoV-2 basado en qPCR en el Institut Pasteur de Madagascar, basado en IGI proyecto. Usaremos la secuenciación de próxima generación para observar las secuencias de ARN viral en muestras positivas. Estos datos se utilizarán luego para desarrollar modelos epidemiológicos y filodinámicos de la propagación del SARS-CoV-2 en Madagascar.
Estamos particularmente interesados en estimar el momento del origen del virus en la isla, la tasa de subregistro de recuentos de casos positivos y los patrones de conectividad que informarán las intervenciones de salud pública destinadas a reducir la transmisión desde la ciudad capital al resto del país.
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