Desde el desarrollo de la edición del genoma CRISPR-Cas9 en 2012Desde entonces, los investigadores han puesto a disposición de los investigadores docenas de enzimas y variantes Cas. El conjunto de herramientas siempre está en expansión, con enzimas que pueden ofrecer más precisión, tamaño más pequeño e incluso funciones diferentes. El laboratorio de doudna en el IGI ha creado un recurso completo y gratuito para ayudar a los investigadores a elegir qué enzima se adapta mejor a sus necesidades experimentales: CasPEDIA.
CasPEDIA es una base de datos de estilo wiki con capacidad de búsqueda de enzimas Cas de Clase 2, que detalla propiedades que incluyen la estructura de las proteínas, la actividad de la nucleasa, los requisitos objetivos, los usos anteriores y las aplicaciones previstas. La base de datos también presenta una nomenclatura funcional novedosa, CasID, inspirada en el sistema numérico de la Comisión de Enzimas (CE). Los CasID agilizan la identificación de nucleasas al consolidar las propiedades enzimáticas en un sistema de 3 decimales.
El equipo del laboratorio de Doudna continuará actualizando la base de datos y, al igual que Wikipedia, se anima a los usuarios a agregar entradas ellos mismos. ¡Explora haciendo clic en el botón de abajo!
Obtenga más información sobre CasPEDIA:
- CasPEDIA: una clasificación funcional de las enzimas Cas
- Base de datos CasPEDIA: un sistema de clasificación funcional para enzimas CRISPR-Cas de clase 2
Otros recursos del IGI: