Philippa Steinberg
Científicos voluntarios analizarán muestras de pacientes en el nuevo IGI Laboratorio de pruebas de diagnóstico COVID-19, con un tiempo de respuesta de menos de 24 horas.
La pandemia de COVID-19 está empeorando y los EE. UU. Tienen una falta crítica de capacidad de prueba rápida, accesible y confiable. Para rastrear y contener el virus, debemos probar a más personas. En respuesta a esta necesidad urgente, el Instituto de Genómica Innovadora (IGI) ha lanzado un ambicioso esfuerzo para establecer un laboratorio de pruebas de diagnóstico de COVID-19 en el campus de UC Berkeley. El UC Berkeley Tang Center y los centros médicos alrededor de East Bay recolectarán muestras de pacientes, y analizaremos estas muestras para SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19.
Usando robótica y un proceso optimizado, el laboratorio de pruebas IGI pronto realizará 1000 pruebas por día, con la capacidad de realizar hasta 3000 pruebas por día si es necesario. En coordinación con el UC Berkeley Tang Center y bajo las pautas revisadas de los CDC, FDA, CDPH y una declaración de emergencia del gobernador Gavin Newsom, podemos acelerar el proceso de aprobación de pruebas clínicas.
Esperamos comenzar a analizar muestras de pacientes dentro de una semana, lo que aumentará significativamente la capacidad y la velocidad de las pruebas en el Área de la Bahía.
El IGI es una asociación de investigación del Área de la Bahía fundada por Jennifer Doudna, co-desarrolladora de CRISPR. “Estamos interesados en servir al bien público”, dijo Doudna. "La experiencia en nuestro instituto y en nuestra comunidad puede abordar esta emergencia de salud pública a través del tipo de coordinación de la que somos especialmente capaces".
A las pocas horas de realizar una convocatoria de voluntarios, más de 800 investigadores locales se ofrecieron a ayudar en nuestros esfuerzos de prueba. Durante las últimas dos semanas, los investigadores, el personal y los voluntarios locales del IGI han trabajado las veinticuatro horas del día para poner en marcha las pruebas. La colaboración con empresas locales de biotecnología y gestión de datos ha sido fundamental para estos esfuerzos.
"Los primeros objetivos son la seguridad del personal y la minimización de los errores humanos, y el segundo es acelerar el resultado", dijo Fyodor Urnov, Director Científico de Tecnología de IGI y Traducción y líder de los esfuerzos de prueba. “Nos sentamos y dijimos: '¿Cómo diseñamos esto para que tenga éxito, incluso en el peor de los casos, para la cantidad de pruebas que tenemos que hacer?'”
La prueba que estamos utilizando comienza con una prueba basada en RT-PCR establecida y aprobada por la FDA que busca la presencia de genoma viral moléculas de ARNy acelera el rendimiento sin sacrificar la precisión.
“Todos nuestros laboratorios PCR todos los días ”, dijo Doudna. “Pero para esta prueba tenemos que ir más allá para asegurarnos de que podemos proporcionar una detección precisa. Implementamos una canalización robótica para realizar miles de pruebas por día, con una canalización para administrar los datos y devolverlos a los médicos. Imagínese configurar eso, un proceso que normalmente tomaría meses o años, en un par de semanas. Es realmente extraordinario y no es algo que haya visto en mi carrera ”.
Los resultados de las pruebas del IGI se proporcionarán a los trabajadores de la salud dentro de las 12 a 24 horas posteriores a la recolección de la muestra, una mejora dramática con respecto a los tiempos de respuesta típicos de 5 a 7 días. Los resultados rápidos de las pruebas son una necesidad para aislar, rastrear y contener el virus.
Nuestro protocolo de prueba rápida se desarrolló en cooperación con esfuerzos similares en Chan Zuckerberg Biohub, y no hubiera sido posible sin el apoyo de Guy Nicolette, vicecanciller adjunto de UC Berkeley Health Services; Robert Tjian, profesor de Molecular y Molecular de la UC Berkeley Celular Biología; Randy Katz, vicerrector de Investigación de UC Berkeley; y Mike Botchan, Decano de Ciencias Biológicas de UC Berkeley.
El IGI también ha establecido alrededor de una docena de equipos de investigación de respuesta rápida COVID-19 para esfuerzos a más largo plazo. "Los coronavirus han existido durante mucho tiempo y no esperamos que desaparezcan pronto", dijo Doudna. Esta investigación es crucial para responder a la pandemia actual y a los brotes futuros.
Más de un centenar de investigadores locales se unieron para formar los equipos de respuesta rápida en solo unos días, formando nuevas colaboraciones para abordar esta crisis de salud pública. Los equipos se centran en el diagnóstico, la terapéutica y la administración terapéutica de COVID-19.
Un equipo está trabajando para usar CRISPR proteínas hacer barato diagnóstico que podría usarse en casa. Otro equipo está trabajando para llevar moléculas terapéuticas directamente a los pulmones. Otra investigación se centra en probar superficies en la comunidad y portadores asintomáticos para comprender mejor cómo se propaga el virus. Estos son solo algunos de los esfuerzos innovadores en curso, que unen a instituciones como UC Berkeley, UCSF, los Institutos Gladstone, UC Davis y Stanford.
"Estos grupos se unieron a una velocidad asombrosa", dijo Urnov. “Ser testigo de este espíritu de equipo ha sido uno de los honores de mi vida profesional. No importa donde trabajes. El nivel de camaradería, el espíritu de un objetivo compartido, es nada menos que inspirador ".
El innovador Genómica Institute (IGI) es una asociación académica sin fines de lucro entre UC Berkeley y UC San Francisco que apoya proyectos de investigación colaborativa en el Área de la Bahía. El IGI imagina un mundo en el que genoma,-Las innovaciones en ingeniería benefician a la humanidad y son accesibles para todos. Como pioneros en edición del genoma, genómica funcional y otras tecnologías de vanguardia, los científicos de IGI continuamente traspasan los límites de la ciencia.
Contacto con los medios
Andy Murdock: andymurdock@berkeley.edu
