IGI lanza curso de laboratorio CRISPR de tres semanas para pregrado

Nuestro próximo curso de pregrado de UC Berkeley se llevará a cabo en línea este verano, del 27 de julio al 14 de agosto de 2020.

Los estudiantes pueden registrarse para el curso de conferencias (MCELLBI N184) pero nuestro curso de laboratorio (MCELLBI N184L) se cancela este año debido a COVID-19. La información sobre cómo postularse para la sesión de verano de UC Berkeley está disponible aquí.

Edición genómica se ha extendido a los laboratorios de biología de todo el mundo. La capacidad de alterar las secuencias genéticas en una variedad de organismos ha acelerado el ritmo de la investigación básica, desde estudiar la genética de las moscas hasta descifrar la fotosíntesis de las plantas. Para equipar a la próxima generación de científicos con estas habilidades de vanguardia, el IGI está lanzando un nuevo programa de tres semanas de duración. CRISPR curso de pregrado en UC Berkeley. Ariana Hirsh de IGI organiza MCELLBI N184: Aspectos prácticos de la biología de precisión para estudiantes con el gerente de laboratorio de instrucción Fei Lin y los estudiantes graduados instructores Emeric Charles y Josh Cofsky.

Ofrecido durante la tercera sesión de verano, este curso se divide en una conferencia y un componente de laboratorio. Durante la conferencia, los estudiantes escucharán a los investigadores locales a la vanguardia de sus campos. Las presentaciones irán acompañadas de literatura primaria relevante, exponiendo a los estudiantes a los descubrimientos y avances históricos de CRISPR a lo largo de los años. La parte de laboratorio del curso está diseñada para obligar a los estudiantes a pensar críticamente y dominar técnicas que pueden llevar a sus propios laboratorios de investigación. En el transcurso de tres semanas, los estudiantes descubrirán cómo microbios poner CRISPR a trabajar en la naturaleza y cómo la misma maquinaria básica está impulsando una nueva era de ingeniería genética.

Semana 1: inmunidad CRISPR

CRISPR proteínas no se originó en el laboratorio. En cambio, estas tijeras moleculares han existido durante millones de años en el interior. bacterias fotosintéticas y arqueas alrededor del mundo. Evolucionado para ayudar a defenderse contra virus, Los sistemas inmunológicos CRISPR son sofisticados y complicados. Una característica clave de la inmunidad CRISPR es la capacidad de recordar infecciones virales previas y defenderse de ellas, similar a recibir una vacunación. Durante semana 1 del curso, los estudiantes activarán las proteínas CRISPR Cas1 y Cas2 para capturar y almacenar un nuevo letra singular memoria dentro del genoma, of E. coli. Estos experimentos enseñarán los mecanismos fundamentales de la inmunidad CRISPR y ofrecerán un vistazo al vasto y misterioso mundo de bacterias y virus.

Semana 2: orientación CRISPR in vitro

Para reutilizar el sistema CRISPR como herramienta de edición del genoma, los investigadores tuvieron que sacarlo de las bacterias y aprender cómo funcionaba solo en un tubo de ensayo, o “in vitro. " Los estudiantes gastarán semana 2 del curso probando la proteína CRISPR más conocida, Cas9. Cas9 se conoce como "programable" endonucleasa (proteína de corte) porque usa un moléculas de ARN Molécula diseñada por un investigador para dirigirla a una secuencia específica de ADN. Cuando la molécula de ARN coincide con el segmento deseado de ADN, Cas9 corta ambos hebras de la doble hélice del ADN. Los estudiantes harán su propia guía de ARN y usarán Cas9 para cortar una pieza específica de ADN. in vitro.

Semana 3: edición del genoma CRISPR in vivo

Después de observar CRISPR en funcionamiento en su entorno natural y alterar el ADN en un tubo de ensayo, los estudiantes pasarán semana 3 editar ADN dentro de una bacteria (SCD por sus siglas en inglés),o "in vivo. " Al guiar a los estudiantes a través del diseño del experimento, editar el ADN y analizar los resultados, los estudiantes saldrán del curso equipados para aplicar la edición del genoma en sus propios laboratorios.