Un año después, un equipo de graduados recientes de la UC y estudiantes actuales impulsa el laboratorio de pruebas IGI.
El 13 de marzo de 2020, los miembros de IGI se reunieron, algunos en persona, algunos llamando a través de Zoom, para hablar sobre cómo podríamos usar nuestros conocimientos, habilidades y recursos para abordar la pandemia de COVID-19. En ese momento, las pruebas de diagnóstico eran un cuello de botella para abordar y contener la pandemia, y al final de esa conversación, los miembros de IGI acordaron que abrir un laboratorio de pruebas era una forma en que podíamos servir a la comunidad local del Área de la Bahía. inmediatamente.
Un esfuerzo masivo y vertiginoso, en coordinación con University Health Services y bajo las pautas revisadas de los CDC, FDA, CDPH y una declaración de emergencia del gobernador Gavin Newsom, nos permitió acelerar el proceso de aprobación de pruebas clínicas. El 6 de abril, solo tres semanas después, el primeras muestras de prueba fueron procesados por científicos voluntarios en el Edificio IGI.
Desde las primeras pruebas realizadas manualmente en abril de 2020, el laboratorio se ha ampliado para ejecutar 14,000 pruebas por semana en promedio y más de 200,000 en total, satisfaciendo las necesidades del campus de Berkeley y brindando pruebas a los trabajadores de primera línea y a las poblaciones desatendidas en East Bay.
"Se desconocía mucho sobre COVID-19 cuando comenzamos nuestra respuesta rápida, pero estábamos muy motivados y dedicados a hacer esto realidad", dice Abby Stahl, uno de los codirectores técnicos que desempeñó un papel fundamental en el establecimiento de la lab en marzo de 2020. “Cuando hicimos nuestra última ronda de experimentos de validación, estábamos usando muestras positivas confirmadas. Nos vestimos con trajes Tyvec, máscaras N95, protectores faciales y nos pusimos dos guantes en las manos por primera vez. Después de eso, tuvimos nuestras primeras muestras de pacientes, que se sintieron enormemente sagradas. Fue la qPCR más importante que hice en mi vida, poder tomar esas muestras clínicas y darle a un paciente su resultado ”.
Un año después, el laboratorio de pruebas se ha convertido en un laboratorio clínico permanente en el IGI. Para convertirnos en un esfuerzo sostenible y equitativo, pasamos de una operación basada en voluntarios a contratar personal de tiempo completo para ejecutar la operación. Sin ser visto por los miles de estudiantes, personal y profesores de Cal que se someten a pruebas cada semana, este equipo de 15 graduados recientes de la Universidad de California realiza las pruebas diarias en el laboratorio y 20 estudiantes-trabajadores de pregrado de UC Berkeley construyen cada kit de prueba. a mano para mantener el campus funcionando de manera segura.
Desde las primeras pruebas realizadas manualmente en abril de 2020, el laboratorio se ha ampliado con la ayuda de robótica y protocolos mejorados para ejecutar 14,000 pruebas por semana en promedio y más de 200,000 en total, satisfaciendo las necesidades del campus de Berkeley y proporcionando pruebas a trabajadores de primera línea y poblaciones desatendidas en East Bay. Conozca a tres de los miembros actuales del equipo de pruebas a continuación.
La historia de William
“A fines de julio, un amigo de la banda de música de UC Berkeley dijo que él era parte del estudio de prueba de saliva asintomática COVID-19 y que estaban buscando ayuda adicional.
¡Había estado buscando ayudar con la pandemia y esta era una oportunidad perfecta para saltar a la refriega! Pronto estuve ayudando en los quioscos de estudio. ¡No sé cuántas personas pueden decir que han sido un 'entrenador de saliva' antes!
En octubre, comencé a armar los kits de hisopos nasales para los estudiantes de pruebas de vigilancia en el campus. Y en diciembre solicité un trabajo que realmente procesaba las muestras de prueba en el laboratorio de pruebas de diagnóstico. Mis colegas y yo operamos los robots que realizan la mayor parte del pipeteo, etc. MCB150L - el celulares y el curso de inmunología molecular que tomé cuando era estudiante, me enseñó a pipetear, trabajar con técnicas estériles y otras habilidades que necesitaba en el laboratorio.
Las personas que he conocido en el IGI en general han sido algunas de las personas más amables que he conocido en todos mis años en Berkeley. Hablamos en serio cuando debemos serlo, pero nos divertimos mucho en el laboratorio y la gente disfruta de lo que está haciendo ".
La historia de imán
“Obtuve mi doctorado. en Biología Vegetal y Microbiana, al otro lado de la calle del IGI.
En mi trabajo de tesis, utilicé la próxima generación letra singular secuenciación de la encuesta microorganismos en viviendas públicas y viviendas de propiedad privada. Pude comprobar que, tal como habían dicho los vecinos de la vivienda pública, estaban teniendo más problemas con las toxinas ambientales y el moho. Me apasiona desmantelar el racismo ambiental a través de la ciencia y la política durante mucho tiempo.
Entonces, después de terminar mi doctorado, en realidad estaba trabajando para la ciudad de Berkeley en una oficina legislativa. En ese papel, me veía a mí mismo como un servidor público, dispuesto a hacer cualquier cosa. Cuando comenzó la pandemia, quise hacer lo que pudiera para servir. Comencé a trabajar para el laboratorio en junio y he tenido muchos roles: procesar pruebas, ejecutar los robots, y ahora trabajo principalmente en el análisis de datos y en informar los resultados de las pruebas a los médicos.
Lo que más me gusta del IGI es que tenemos una misión realmente increíble de servir al público, no solo a los privilegiados. Nuestro socio principal es el campus. Pero fuera de eso, hacemos un trabajo realmente sobresaliente con los socios de la comunidad. Atendemos específicamente a comunidades de bajos ingresos, negros, morenos, indígenas e indocumentados. Creo que es realmente asombroso y estoy orgulloso de eso. También estoy orgulloso de que nuestras pruebas no tengan fines de lucro ".
La historia de Matt
“Fui a Cal para la licenciatura y volví a Cal para un postdoctorado en biología evolutiva, que terminó cuando comenzó la pandemia. Entré en junio como uno de los primeros contratados, hice los PCR y procesé las pruebas, y pasé a las operaciones de laboratorio.
Crecí trabajando en restaurantes y trabajé en Jupiter en Shattuck en la licenciatura. La experiencia que tuve con la eficiencia del estilo de producción ha sido invaluable. Tenemos robots de un millón de dólares en lugar de hornos y pipetas en lugar de cuchillos. En el laboratorio, hice un sistema de tickets para todas las placas de muestra. Es como una cena: agarre su boleto, vea qué se debe hacer a continuación y hágalo. También ha sido muy divertido trabajar con todos los robots, cuando las cosas no funcionan, averiguar por qué y cómo solucionarlo.
Hemos tenido varios aumentos repentinos en las muestras, como alrededor del Día de Acción de Gracias. Cada vez que sobrevivimos y descubrimos cómo mejorar. La capacidad de las pruebas que podemos manejar fácilmente se ha multiplicado por diez desde que abrió el laboratorio. No puedo enfatizar lo suficiente que ha sido un tremendo esfuerzo grupal poner en funcionamiento el laboratorio, desde los postdoctorados que diseñaron el ensayo hasta las personas que realizan un trabajo administrativo crucial y los estudiantes universitarios que están haciendo los kits. El trabajo ha tomado todas estas formas diferentes y hemos tenido que ser súper adaptables ".
En el futuro, el laboratorio continuará monitoreando la comunidad de Berkeley para SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19. “Necesitamos estar atentos”, dice Petros Giannikopoulos, MD, Director del Laboratorio Clínico, “porque el SARS-CoV-2 puede mutar o estallar. Somos parte de la infraestructura de la Universidad y la ciudad para poder responder instantáneamente a cualquier brote ”. El laboratorio también está trabajando en la validación CRISPR-pruebas de diagnóstico basadas en COVID-19.
El laboratorio tiene planes más allá de COVID-19: crear herramientas de diagnóstico para terapias basadas en CRISPR. "Se presta mucha atención a los diagnósticos que le dicen si tiene una condición ”, dice Giannikopoulos. “Pero después de un diagnóstico, es necesario controlar el bienestar y los tratamientos del paciente. Esa es la parte de la que estamos hablando. Necesitamos herramientas que nos digan qué tan bien funcionan las terapias CRISPR en un paciente y si existen efectos secundarios a nivel molecular ".
Actualmente, Giannikopoulos está trabajando con Fyodor Urnov, Director de Tecnología de IGI y Traduccióny un consorcio de UC para desarrollar una plataforma de secuenciación de ADN de próxima generación para observar la eficacia de un nuevo Tratamiento basado en CRISPR para la anemia de células falciformes. Su meta es secuenciar la sangre de un paciente células madre en el laboratorio este año.
