Cuando ambos hebras of letra singular se rompen, se crean dos extremos libres. Puede hacerse intencionalmente con una herramienta como Cas9. Células reparar su ADN para prevenir la muerte celular, a veces cambiando la secuencia de ADN en el sitio de la ruptura. Iniciar o controlar este proceso con la intención de alterar una secuencia de ADN se conoce como ingeniería del genoma.
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