El Instituto de Genómica Innovadora (IGI) y Apple Tree Partners (ATP) se han asociado para crear el nuevo Centro para el Descubrimiento de Objetivos CRISPR (CCTD) en el Edificio IGI en UC Berkeley. A través del CCTD, los científicos reciben generosos fondos y acceso a las instalaciones de laboratorio de IGI para avanzar en proyectos de 1 a 2 años de duración destinados a acelerar el tratamiento y la prevención de enfermedades humanas mediante el interrogatorio y la validación de nuevos objetivos farmacológicos.

General

El Centro para el descubrimiento de objetivos CRISPR es un laboratorio de genómica funcional de última generación creado por IGI y la firma de capital de riesgo de ciencias de la vida Socios del manzano (ATP) para utilizar el poder de las tecnologías basadas en CRISPR para acelerar la exploración y validación de nuevos objetivos biológicos que pueden traducirse en terapias novedosas para responder a necesidades no satisfechas.

En el otoño de 2021, se extendió una solicitud de propuestas a los miembros de las comunidades de investigación de UC Berkeley y UC San Francisco que tienen interés en utilizar la genómica funcional basada en CRISPR para el descubrimiento y la validación de objetivos genéticos relacionados con enfermedades, junto con la intención de encontró una empresa en función de los resultados del proyecto o la voluntad de colaborar con ATP en sus esfuerzos por fundar una nueva entidad comercial para desarrollar estos descubrimientos.

Beneficiarios de subvenciones CCTD 2023

El IGI y la ATP agradecen a todos los solicitantes de 2022 por su interés en el Center for CRISPR Target Discovery. Tras un riguroso proceso de evaluación, las siguientes personas han recibido financiación para proyectos de investigación:

joe derisi, Ph.D.

Joe DeRisi es profesor de bioquímica y biofísica en la Universidad de California, San Francisco y presidente de Chan Zuckerberg Biohub. DeRisi es un científico interdisciplinario cuyo trabajo combina la genómica, la bioinformática, la bioquímica y la bioingeniería para estudiar enfermedades autoinmunes, parasitarias y virales en una amplia gama de organismos. Recibió una licenciatura en Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de California, Santa Cruz y un Ph.D. en Bioquímica de la Universidad de Stanford.

Samantha Lewis, Ph. D.

Samantha Lewis es bióloga molecular y celular y profesora asistente en la Universidad de California, Berkeley. Su investigación investiga cómo las células animales aseguran el suministro continuo de energía que necesitan para sobrevivir, y cómo esto falla en las enfermedades humanas. Su equipo de laboratorio se enfoca en las mitocondrias, el "centro neurálgico de la célula", que alberga su propio modelo genómico llamado ADN mitocondrial. El enfoque experimental de Lewis aprovecha la microscopía en vivo a alta resolución espacial y temporal, los análisis de células individuales de la replicación y transcripción del ADN, la edición de genes, la proteómica y la genética para revelar cómo las células se replican, segregan y heredan este "genoma descuidado". Lewis obtuvo su licenciatura en la Universidad Estatal de Oregón y su doctorado. de la Universidad de California, Riverside.

Davide Ruggero, Ph.D.

Davide Ruggero es profesor del Departamento de Urología y de Farmacología Celular y Molecular de la Universidad de California, San Francisco (UCSF). También ocupa la Cátedra de Investigación Básica del Cáncer de la Familia Helen Diller en UCSF. El Dr. Ruggero se unió a la UCSF en julio de 2007 procedente del Centro Oncológico Fox Chase en Filadelfia, donde fue profesor asistente en el Departamento de Genética Humana. Recibió la cátedra titular en 2013. Su investigación amplía las líneas tradicionales de investigación sobre la biología del cáncer y ha descubierto una nueva capa de control de la regulación genética del cáncer. El Dr. Ruggero ha recibido múltiples premios y distinciones por su destacada investigación en biología del cáncer.

Roberto Saxton, Ph.D.

Robert Saxton es profesor asistente de inmunología y medicina molecular y química en la Universidad de California, Berkeley. El laboratorio de Saxton estudia los mecanismos de comunicación celular que controlan la inflamación, la reparación y la homeostasis de los tejidos, con el objetivo de desarrollar nuevas terapias para modular estas vías en la enfermedad. Su programa de investigación multidisciplinario utiliza una variedad de técnicas bioquímicas y de biología estructural, junto con enfoques de vanguardia en ingeniería de proteínas, farmacología de receptores y modelos de inflamación en ratones para comprender y controlar la señalización inflamatoria a nivel atómico, celular y de organismos. El Dr. Saxton recibió su BA de la Universidad de California, Berkeley, y su Ph.D. del Instituto de Tecnología de Massachusetts. 

Jack Taunton, Ph.D.

Jack Taunton es profesor de Farmacología Molecular Celular y miembro del Programa del Centro de Cáncer de la Universidad de California en San Francisco. Su laboratorio desarrolla herramientas químicas y bioquímicas para iluminar procesos celulares relevantes para el cáncer y las enfermedades autoinmunes. Su laboratorio de investigación es un grupo colaborativo de biología química con intereses científicos diversos que incluyen el diseño de inhibidores covalentes, métodos quimioproteómicos, productos naturales y mecanismos de proteostasis.

Dean Toste, Ph.D., y Christopher Chang, Ph.D.

Dean Toste es el Profesor Distinguido de Química de la Rama Gerald EK en la Universidad de California, Berkeley. Es reconocido por su trabajo en el desarrollo y estudio de catalizadores y reacciones catalíticas. Es conocido particularmente por sus trabajos pioneros en catálisis de oro homogéneo y catálisis de aniones quirales y, en general, por su enfoque guiado mecánicamente para el descubrimiento de reacciones. Toste nació en Azores, Portugal y creció en Toronto, Canadá. Se graduó de la Universidad de Toronto con una licenciatura en Química y Bioquímica y obtuvo su Ph.D. de la Universidad de Stanford. Es miembro electo de la Royal Society of Canada, Academy of Sciences, American Academy of Arts and Sciences y miembro de la National Academy of Sciences.

Christopher Chang es profesor de química, profesor de biología molecular y celular, miembro del Instituto de Neurociencia Helen Wills de la Universidad de California, Berkeley, y profesor adjunto de la Universidad de California, San Francisco. El Laboratorio Chang estudia la química de la biología y la energía. Avanzan nuevos conceptos en imágenes, proteómica, descubrimiento de fármacos y catálisis a partir de disciplinas centrales de química inorgánica, orgánica y biológica. Chang obtuvo su BS y MS en Química en el Instituto de Tecnología de California y su Ph.D. en el Instituto Tecnológico de Massachusetts.

Beneficiarios de subvenciones CCTD 2022

Daniel K. Nomura, Ph.D.

Dan Nomura es profesor de Biología Química en los Departamentos de Química, Biología Molecular y Celular, y Ciencias de la Nutrición y Toxicología de la Universidad de California, Berkeley, y Profesor Adjunto en el Departamento de Química Farmacéutica de la UCSF. Desde 2017, también ha sido el director del Centro Novartis-Berkeley de Proteómica y Tecnologías Químicas centrado en el uso de plataformas quimioproteómicas para abordar el proteoma no farmacable. También es cofundador y director del Consejo Asesor Científico de Frontier Medicines y forma parte del comité asesor científico de la Fundación Mark para la Investigación del Cáncer. Nomura obtuvo su licenciatura en Biología Molecular y Celular y su Ph.D. en Toxicología Molecular en UC Berkeley con el Profesor John Casida y fue becario postdoctoral en Scripps Research con el Profesor Ben Cravatt antes de regresar a Berkeley como miembro de la facultad en 2011. Entre sus honores se encuentran su selección como Becario Searle, Premio Académico de Investigación de la Sociedad Americana del Cáncer , el Premio Breakthroughs del Departamento de Defensa, el Premio al Investigador Joven de la Fundación de Investigación de Eicosanoides y el premio ASPIRE de la Fundación Mark para la Investigación del Cáncer. 

El Grupo de Investigación Nomura en UC Berkeley se centra en reinventar la capacidad de los medicamentos utilizando plataformas quimioproteómicas para desarrollar medicamentos transformadores.

James Olzmann, Ph. D.

James Olzmann es profesor asociado de Biología Molecular y Celular y Ciencias de la Nutrición y Toxicología en la Universidad de California, Berkeley, e investigador en Chan Zuckerberg Biohub. Su grupo de investigación estudia la biología celular de la homeostasis de los lípidos y su relevancia para las enfermedades humanas, incluidas las enfermedades metabólicas y el cáncer. Licenciado en biología de la Universidad de Michigan, Olzmann obtuvo su doctorado. en neurociencia en la Universidad de Emory. Como becario postdoctoral en biología en la Universidad de Stanford, descubrió una conexión entre el control de calidad de la proteína del retículo endoplásmico y las gotitas de lípidos, centros celulares del metabolismo de los lípidos que suministran ácidos grasos que pueden emplearse para la energía, la biogénesis de la membrana y las vías de señalización de los lípidos. Este descubrimiento llevó a Olzmann a profundizar su enfoque en la biología de las gotas de lípidos y los mecanismos que emplean las células para prevenir la lipotoxicidad. Algunos de sus honores incluyen el Premio Presidencial de Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros (PECASE), el Premio Günter Blobel de Carrera Temprana de la Sociedad Estadounidense de Biología Celular, el Premio de Cátedra del Instituto Miller y el Premio Académico de Investigación de la Sociedad Estadounidense del Cáncer.

Esfuerzos actuales en el Laboratorio de Olzmann integrar estrategias a nivel de sistemas, biología química y biología celular para comprender la regulación de las gotas de lípidos y los mecanismos que suprimen el daño de los lípidos durante una vía de muerte celular regulada conocida como ferroptosis.

David Raulet, Ph.D.

David Raulet es un inmunólogo e investigador del cáncer que se centra en el papel de los linfocitos citotóxicos, incluidas las células NK y las células T, en la destrucción de las células tumorales. Es conocido por definir los mecanismos de reconocimiento de células cancerosas por parte de las células NK; cómo las moléculas MHC y similares a MHC determinan la inhibición, activación y educación de las células NK; reconocimiento intrínseco de células T de moléculas MHC; y reordenamiento del gen TCR regulado. Raulet se graduó de la Universidad de Michigan con una licenciatura en Microbiología y del MIT con un Ph.D. en Biología. Fue becario postdoctoral en el Departamento de Patología de la Facultad de Medicina de la Universidad de Pensilvania. Se unió a la facultad en el Departamento de Biología del MIT y posteriormente se trasladó al Departamento de Biología Molecular y Celular de la Universidad de California, Berkeley. Es miembro de la Academia Nacional de Ciencias.

El Laboratorio Raulet investiga los mecanismos por los cuales las células asesinas naturales y las células T reconocen las células cancerosas y las células infectadas, y por los cuales los tumores y los agentes infecciosos activan o inhiben naturalmente las respuestas productivas de las células citotóxicas, o insensibilizan las células induciendo anergia. El objetivo de esta investigación es aplicar sus hallazgos para mejorar las inmunoterapias existentes para el cáncer y diseñar otras nuevas.

Lani Wu, Ph.D., y Steven Altschuler, Ph.D.

Lani Wu y Steve Altschuler son profesores en el Departamento de Química Farmacéutica de la Universidad de California, San Francisco (UCSF). Juntos, han desarrollado un programa de investigación que combina biología experimental, ciencias de datos y modelado para atacar problemas fundamentales en biología celular y descubrimiento de fármacos. La pareja tomó un camino no lineal hacia la biología, con carreras de investigación que comenzaron en matemáticas en la interfaz del análisis y la geometría. Hicieron la transición a ingeniería en Microsoft, donde codirigieron un equipo de invención que desarrolló enfoques de aprendizaje automático para mejorar las interacciones entre humanos y computadoras, incluso en las áreas de visión artificial, redes sociales y reconocimiento de voz ruidoso. Entraron en biología de sistemas y farmacología a través de la startup de biotecnología Rosetta Inpharmatics. Wu y Altschuler han sido miembros pioneros del programa Bauer Fellow de la Universidad de Harvard y del Centro Verde de Biología de Sistemas de la UTSW y se han desempeñado como profesores visitantes en MSRI en Berkeley y Google Brain. Son cofundadores de la empresa de cartera ATP Nine Square Therapeutics.

El Altschuler y Wu Labs en UCSF abordan preguntas a nivel de sistemas en biología, enfermedades y farmacología.

Andrew Yang, Doctor en Filosofía.

Andrew Yang es miembro de la facultad de Sandler en la Universidad de California, San Francisco (UCSF) en el Instituto de Investigación del Envejecimiento de Bakar y el Departamento de Anatomía. Su laboratorio desarrolla nuevos enfoques moleculares para decodificar la comunicación de proteínas y células inmunitarias en la interfaz crítica donde el cerebro se encuentra con el cuerpo. Comprender los mecanismos, el significado y la relevancia terapéutica de estos mensajes informará nuevas vías para mejorar la administración de fármacos y mejorar la resiliencia contra las enfermedades neurodegenerativas.

Martín Campmann

Martin Kampmann es profesor asociado en el Departamento de Bioquímica y Biofísica de la UCSF y en el Instituto de Enfermedades Neurodegenerativas. Recibió su BA en Bioquímica de la Universidad de Cambridge y su Ph.D. en Biofísica/Biología Celular de la Universidad Rockefeller. Co-inventó las tecnologías de detección CRISPRi y CRISPRa, y su laboratorio ha sido pionero en las pantallas basadas en CRISPR en tipos de células cerebrales humanas, como neuronas, microglía y astrocitos. Aprovecha esta tecnología única para descubrir mecanismos y nuevas estrategias terapéuticas para la enfermedad de Alzheimer y otras enfermedades neurodegenerativas. Kampmann fue nombrado Nuevo Innovador del Director del NIH, Investigador Distinguido de Allen, Premio de Aceleración de Carrera Temprana Ben Barres de la Iniciativa Chan Zuckerberg y recibió el Premio Rainwater para Científicos Innovadores de Carrera Temprana.

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