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Seminario Peter Turnbaugh: Domesticación de bacterias intestinales humanas para obtener conocimientos mecanicistas sobre la etiología y el tratamiento de la enfermedad
Si bien décadas de estudio de organismos modelo han revolucionado nuestra comprensión del mundo microbiano, la gran mayoría de los organismos asociados a humanos microorganismos siguen siendo "salvajes": carecen de herramientas funcionales que permitan su interrogatorio funcional. Nuestro grupo de investigación está trabajando para construir enfoques generalizables para descubrir y caracterizar el bacteriano especies, los genesy enzimas CRISPR-Cas relevante para las enfermedades humanas, con un enfoque particular en el metabolismo bacteriano intestinal de fármacos no antibióticos y compuestos derivados de la dieta. Discutiré nuestros esfuerzos iniciales enfocados en eggthella lenta, un Actinobacterium del intestino humano poco estudiado pero prevalente que se cree que juega un papel clave en el metabolismo y patogénesis. Estos estudios interdisciplinarios utilizan una combinación de metagenómica análisis, comparativo genómica, heterólogo expresióny bioquímica. Finalmente, discutiré nuestros esfuerzos en curso para establecer una nueva herramienta genética que aproveche las bacterias intestinales endógenas. CRISPR-Proteínas Cas sistema de E. lenta para apuntar a genes específicos de interés. Juntos, estos resultados proporcionan una base para desarrollar herramientas modulares para predecir el metabolismo microbiano intestinal y el diseño racional de comunidades microbianas para un resultado deseado.
Domesticar bacterias intestinales humanas para obtener conocimientos mecanicistas
en la etiología y el tratamiento de la enfermedad
Profesor, Departamento de Microbiología e Inmunología
Universidad de California, San Francisco
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