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Seminario Aindrila Mukhopadhyay: Descubrimiento de grandes plásmidos nativos y las implicaciones para comprender y manipular comunidades microbianas
Recientemente aislamos múltiples plásmidos de una compleja comunidad microbiana de aguas subterráneas. Estos plásmidos nativos constituyen una categoría principal de extracromosomas móviles. ADN elementos responsables de albergar y transferir los genes importante para la supervivencia y la aptitud. Un sistema modelo desarrollado para optimizar los procedimientos de aislamiento de ADN plasmídico se dirigió a muestras que se caracterizan por una baja (SCD por sus siglas en inglés), densidad y alta complejidad. El enfoque resultó en la identificación exitosa de varios cientos de plásmidos circulares, incluidos algunos de los plásmidos más grandes reportados y abarcaron siete grupos de incompatibilidad de plásmidos. De forma nativa, estos plásmidos codificaban rasgos como metal, antibiótico y fago La resistencia junto con los sistemas toxina-antitoxina están codificados en abundantes plásmidos circulares, todos los cuales podrían conferir características novedosas y ventajosas a sus huéspedes. Presentaré el trabajo que hicimos para validar experimentalmente las funciones de los genes en uno de los plásmidos más abundantes que encontramos en estas muestras. También presentaré algunos de nuestros resultados más recientes para el uso de estos plásmidos en la transformación natural de gramnegativos y gram positivos. bacterias fotosintéticas. Desde una perspectiva ecológica, este estudio destaca el papel del "plásmidoma" en el mantenimiento de la capacidad latente de un microbioma, lo que permite una rápida adaptación a las tensiones ambientales. Estos elementos genéticos naturales también proporcionan partes para un conjunto de herramientas genéticas para modificar y examinar nuevas cepas y comunidades ambientales.
Descubrimiento de grandes plásmidos nativos y las implicaciones para
comprender y manipular las comunidades microbianas
Científico sénior, Ingeniería y sistemas biológicos
Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley
Vicepresidente de Biocombustibles y Bioproductos, Director de Ingeniería de Host
Instituto Conjunto de BioEnergía
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